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weleozhu銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
使用Sau3AI建立水稻shotgun庫,但連接多次不長,求經(jīng)驗(yàn)大神幫助 已有1人參與
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| 我最近在構(gòu)建一個(gè)水稻的shotgun亞克隆文庫,質(zhì)粒來源是水稻的BAC文庫的一個(gè)BAC質(zhì)粒,使用的是PUC19作為載體,回收的片段為7-10K,酶切質(zhì)粒條件摸索得差不多了,在目的區(qū)域也有比較集中的片段,然后切膠回收后,連接到用BamHI酶切然后用NEB CIP脫磷的PUC19上,問題就出在這,連接轉(zhuǎn)化后就是不見一個(gè)菌斑。 我轉(zhuǎn)化的菌株是XL1-Blue,用的是電轉(zhuǎn)化, 感受態(tài)效率已經(jīng)經(jīng)過驗(yàn)證,沒有問題,符合建庫要求。最近被這個(gè)快煩死了,都快兩個(gè)月了,求求大神棒棒忙,或者改一下方案也行。問題解決了加送金幣。 |
| 今天又看到了該帖,再次說一下我的觀點(diǎn)。我建議你換一管新的BamHI 沒切載體試一下,然后做一個(gè)NEB CIP脫磷前PUC19載體的自連實(shí)驗(yàn),轉(zhuǎn)化后看載體的自連率有多高。上述實(shí)驗(yàn)失敗,有可能是載體完全沒有切開,片段沒法連接進(jìn)去,用CIP脫磷處理后,也不存在載體自連接的情況,故轉(zhuǎn)化后一個(gè)菌落都沒有。以前我們實(shí)驗(yàn)室也碰到過這樣的情況。載體酶切時(shí)適當(dāng)?shù)难娱L酶切的時(shí)間,連接時(shí)置入4℃冰箱,延長連接的時(shí)間。 |
銀蟲 (小有名氣)
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