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luffyheipi銀蟲 (初入文壇)
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[求助]
關(guān)于構(gòu)建基因文庫中Sau3AI , BamHI 均切不動基因組DNA的問題。 已有2人參與
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大家好! 本人初次在小木蟲上發(fā)帖,各方面如有不當(dāng)之處,還望大家包涵。先行謝過了! 我最近在構(gòu)建一株細菌的基因組文庫,大量抽提了基因組DNA 5次,每次DNA的濃度均在1000-2000ng/ul之間,A260/280都在1.8-2.0之間,A260/230也都大于2.0.跑膠檢測,條帶很亮,均一,無拖帶。 然后,問題來了。用Sau3AI預(yù)酶切時,酶切體系是20ul。但是,酶的稀釋比例從5-50倍,酶量2ul,時間從15-120min都試過,幾乎都切不動,酶是新買的。少有的切動的情況,想再次重復(fù)也重復(fù)不出來。之后,改用BamHI,50ul體系,3ul的酶,其他是buffer和DNA。酶切時間從8-24h也都切不動。于是,想檢測一下基因組DNA有沒有什么問題。用基因組DNA作模板,通用引物擴增16S rDNA,都能擴增出來。用DpnI酶切基因組DNA 1h,也切不動。 以上是我遇到的問題,以及嘗試解決問題所做的努力。如有敘述不清楚之處,也請見諒! 懇請有這方面的經(jīng)驗的高手能給我一些指點和建議。將不勝感激! |
functional genomics |
金蟲 (小有名氣)

新蟲 (小有名氣)
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