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po390金蟲 (小有名氣)
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[求助]
VMD與lammpstrj文件 已有2人參與
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我VMD導入用LAMMPS生成的lammpstrj文件時，分子之間的成建情況十分混亂（如下圖），請教各位有什么好的解決方法嗎？ BV83]C2M}C_PC(]T8T5S$@P.png |
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我知道在將原子顯示調(diào)成VDW之后，分子鍵的顯示就不會混亂。但我想解決的是，如何在line的模式下分子鍵不會顯示混亂，更確切的說是讀取lammps軌跡文件時可以讀取到軌跡文件的分子成建信息和拓撲結(jié)構(gòu)信息，是否需要加載類似psf的文件？ 4樓2015-09-28 15:52:59
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