 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1906 | 回復(fù): 3 | ||
| 當(dāng)前只顯示滿(mǎn)足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話(huà)題的所有回帖 | ||
橫刀銅蟲(chóng) (小有名氣)
|
[求助]
如何向溶劑盒子中加溶質(zhì)分子 已有1人參與
|
|
|
想進(jìn)行CO2-夾帶劑體系在一定溫度、壓力條件下的分子動(dòng)力學(xué)模擬。想先建好含1000個(gè)CO2分子的盒子，構(gòu)型優(yōu)化后跑NPT，然后將夾帶劑分子加到盒子中再跑NVT。但在跑完NPT后，將夾帶劑分子復(fù)制粘貼到盒子中時(shí)出現(xiàn)如下提示。請(qǐng)問(wèn)各位高手，這是不是說(shuō)不能用這種方法將夾帶劑分子加入到盒子中？應(yīng)該怎樣加進(jìn)去呢？ Changes to the document have invalidated the connected trajectory. The structure can therefore no longer be animated. To recover the structure for animation, use Undo or close the document without saving and reload it. 3.png |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
317分 一志愿南理工材料工程 本科湖工大 求調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
332求調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
材料專(zhuān)碩 085600求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
0703化學(xué)/290求調(diào)劑/本科經(jīng)歷豐富/工科也可
已經(jīng)有14人回復(fù)
-
283求調(diào)劑（080500）
已經(jīng)有14人回復(fù)
-
材料工程專(zhuān)碩求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
材料專(zhuān)碩調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
求調(diào)劑 有機(jī)化學(xué)考研356分
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
環(huán)境科學(xué)與工程334分求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
考研調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- gromacs中，一個(gè)小分子然后加水是如何操作的？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 水盒子的建模問(wèn)題
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 模擬盒子里面水分子數(shù)目問(wèn)題？？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- gromacs中加入離子的個(gè)數(shù)計(jì)算問(wèn)題
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 做高分子復(fù)合材料膜,請(qǐng)教溶液澆鑄法成膜的一些問(wèn)題
已經(jīng)有26人回復(fù)
- 向什么有機(jī)溶劑中加液氮可以達(dá)到-10°C，不用干冰
已經(jīng)有28人回復(fù)
- Gromacs里關(guān)于設(shè)定水盒子形狀的問(wèn)題？？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 求助，關(guān)于Gromacs生成的水盒子中加小分子。
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 怎么用Amorphous Cell 模塊建立液態(tài)鋁模型(類(lèi)似水盒子模型)？
已經(jīng)有18人回復(fù)
- 怎樣用能量和溫度判斷體系達(dá)到收斂了？（600ps水盒子溫度波動(dòng)還很大）
已經(jīng)有31人回復(fù)
- gromacs蛋白計(jì)算結(jié)束后老是跑出盒子
已經(jīng)有19人回復(fù)
- vmd顯示模擬盒子邊界是不是每一步都得在命令界面上手動(dòng)設(shè)置
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 怎么把金屬晶體置于真空盒子中？
已經(jīng)有6人回復(fù)
- lammps中change_box命令的使用,無(wú)法將模擬體系放在模擬盒子中間位置 急求~!
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 怎么用gromacs模擬混合溶劑？跪求大牛指導(dǎo)。。。
已經(jīng)有15人回復(fù)
- 如何計(jì)算溶劑盒子密度
已經(jīng)有15人回復(fù)
- 水分子的分子動(dòng)力學(xué)模擬中水分子跑出盒子
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 怎樣往有機(jī)溶劑中加酸或堿？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- MS中如何設(shè)置將分子放在模擬盒子的中心處
已經(jīng)有15人回復(fù)
- namd 蛋白質(zhì)溢出水盒子，并且跑的盒子的另一邊
已經(jīng)有10人回復(fù)
- MS建盒子，放入溶質(zhì)，如何再空隙處添加水分子？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- VMD怎么顯示模擬盒子的邊界？
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 請(qǐng)教做MD計(jì)算時(shí)，蛋白質(zhì)分子有一部分跑出水盒子
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】怎樣才能使整個(gè)盒子充滿(mǎn)水,用gromacs
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助】水盒子問(wèn)題
已經(jīng)有17人回復(fù)
趙紅霞
鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 73 (初中生)
- 金幣: 6114.9
- 散金: 141
- 紅花: 33
- 帖子: 1541
- 在線(xiàn): 700.9小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1544094
- 注冊(cè): 2011-12-20
- 性別: MM
- 專(zhuān)業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
4樓2015-05-15 08:46:54
趙紅霞
鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 73 (初中生)
- 金幣: 6114.9
- 散金: 141
- 紅花: 33
- 帖子: 1541
- 在線(xiàn): 700.9小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1544094
- 注冊(cè): 2011-12-20
- 性別: MM
- 專(zhuān)業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
橫刀: 金幣+20, ★★★很有幫助 2015-05-14 22:07:50
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
橫刀: 金幣+20, ★★★很有幫助 2015-05-14 22:07:50
|
樓主，你跑完NVT之后，你的分子就是xtd文件了，它里面包含了很多個(gè)分子構(gòu)象，而復(fù)制粘貼只允許一個(gè)構(gòu)象，這就是錯(cuò)誤提示你不能復(fù)制的原因。 正確的方法，新建一個(gè)xsd文件，把溶質(zhì)分子NVT的最后一幀（最后一個(gè)構(gòu)象）復(fù)制到該xsd文件，這時(shí)候你再?gòu)?fù)制粘貼到你的溶劑中，試試吧 |
2樓2015-05-14 16:57:40
橫刀
銅蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 900
- 散金: 50
- 帖子: 67
- 在線(xiàn): 885.2小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1378277
- 注冊(cè): 2011-08-24
- 專(zhuān)業(yè): 高分子材料結(jié)構(gòu)與性能
3樓2015-05-14 22:15:15
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 085602 化學(xué)工程專(zhuān)碩 340分求調(diào)劑 +4 | qianbai11 2026-03-29 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 300求調(diào)劑，材料科學(xué)英一數(shù)二 +15 | leaflight 2026-03-24 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 一志愿南開(kāi)大學(xué)0710生物學(xué)359求調(diào)劑 +5 | 兔兔兔111223314 2026-03-29 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0703一志愿9，初試成績(jī)：338，四六級(jí)已過(guò)，有科研經(jīng)歷，求調(diào)劑！ +5 | Zuhui0306 2026-03-25 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 317求調(diào)劑 +10 | 蛋黃咸肉粽 2026-03-26 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 各位老師好，我的一志愿為北京科技大學(xué)085601材料專(zhuān)碩 +9 | Koxui 2026-03-28 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑一志愿武漢理工大學(xué)材料工程（085601） +7 | WW.' 2026-03-23 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 332求92調(diào)劑 +8 | 蕉蕉123 2026-03-28 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑考研 +3 | 王杰一 2026-03-29 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 322求調(diào)劑 +5 | 舊吢 2026-03-24 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 266分，求材料冶金能源化工等調(diào)劑 +7 | 哇呼哼呼哼 2026-03-27 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 085701環(huán)境工程，267求調(diào)劑 +16 | minht 2026-03-26 | 16/800 |
|
|
|
[考研] 291求調(diào)劑 +6 | HanBeiNingZC 2026-03-24 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 085601 材料工程 313分 求調(diào)劑 +5 | Ong3 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑323材料與化工 +7 | 1124361 2026-03-24 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑求收留 +7 | 果然有我 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 26考研-291分-廈門(mén)大學(xué)（085601）-柔性電子學(xué)院材料工程專(zhuān)業(yè)求調(diào)劑 +3 | min3 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0854AI CV方向招收調(diào)劑 +4 | 章小魚(yú)567 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 【2026考研調(diào)劑】制藥工程 284分 求相關(guān)專(zhuān)業(yè)調(diào)劑名額 +4 | 袁奐奐 2026-03-25 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 285求調(diào)劑 +3 | AZMK 2026-03-24 | 3/150 |
|