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lyxdjdj新蟲 (初入文壇)
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[求助]
如何顯示對接后蛋白結(jié)合口袋的截面圖 已有2人參與
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本人從事分子模擬不久，已經(jīng)通過Autodock Vina對一些分子進行對接。分析對接結(jié)果的時候不知道如何顯示蛋白口袋的截面圖，以更直觀地看到小分子在什么程度上適應(yīng)蛋白口袋。附圖是Autodock Vina官網(wǎng)上顯示的對接結(jié)果圖，請問如何可以做這樣的圖？ 我已經(jīng)試過用Pymol的present-Ligand site和ADT里面的Protein surface，可是都不能得到附件中所示的樣子。麻煩高手支招有什么軟件可以做到嗎？麻煩給詳細的作圖步驟~~~小女子感激不盡~~~~ 另外，請問有什么軟件可以用于虛擬篩選得到的小分子superimpose還有結(jié)構(gòu)分析？分析官能團，氫鍵受體供體，極性，親脂性和骨架？謝謝大家！ Untitled.jpg |
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5樓2016-07-11 16:15:38
2樓2015-05-14 09:38:23
lyxdjdj
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 98
- 帖子: 6
- 在線: 48分鐘
- 蟲號: 2730316
- 注冊: 2013-10-16
- 專業(yè): 藥物設(shè)計與藥物信息
3樓2015-05-15 06:51:47
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