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_Smile_新蟲 (初入文壇)
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[求助]
Gaussian輸入文件使用內(nèi)坐標(biāo)的問(wèn)題 已有1人參與
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大家好！新蟲一枚，最近在使用內(nèi)坐標(biāo)時(shí)遇到一些問(wèn)題，希望各位大神能指點(diǎn)一二，或者推薦一些相關(guān)文獻(xiàn)資料，謝謝： 問(wèn)題一：對(duì)于線性分子體系，可以直接使用內(nèi)坐標(biāo)（即Z矩陣）嗎？或者必須加入虛原子？ 問(wèn)題二：對(duì)于沒(méi)有加入虛原子的線性分子體系，使用Gauss View打開(kāi)輸入文件，另存為分子內(nèi)坐標(biāo)時(shí)，提示錯(cuò)誤“Bad dihedral angle coordinate for atom 4, consider reordering atoms. Writing Cartesian instead of internal coordinates”.輸出文件中任然是笛卡爾坐標(biāo)。該怎么解決這個(gè)問(wèn)題呢？ |
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6樓2015-06-09 11:02:05
槍下游魂
木蟲 (著名寫手)
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2樓2015-06-08 09:41:35
_Smile_
新蟲 (初入文壇)
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- 性別: MM
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
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終于有人應(yīng)助了�。�！  你好，大神： 問(wèn)題一，剛剛查到，Gaussian網(wǎng)站，“......Geometry optimizations in internal coordinates are unable to handle bond angles of 180 degrees which occur in linear molecular fragments......”因此建議使用虛原子解決。我十分贊同你對(duì)問(wèn)題一的解答！ 問(wèn)題二，我會(huì)按你說(shuō)的方法嘗試一下。另，我覺(jué)得還要同時(shí)加入虛原子。 再次感謝你！ |
3樓2015-06-08 16:09:40
4樓2015-06-08 21:30:21
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