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[交流]
在生物學(xué)中常見的一系列名詞之間的關(guān)系 已有11人參與
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一個蟲友提出了一系列名詞的像話關(guān)系,我突然發(fā)現(xiàn)自己也不是很清楚,根據(jù)我自己的理解作如下分析,希望蟲友們批評指正并作補(bǔ)充: DNA:不多說; genome:一個物種的全部遺傳物質(zhì),真核生物包括核基因和質(zhì)基因; gene:按最新的分子生物學(xué)解釋,包括表達(dá)這個基因產(chǎn)物的全部DNA序列,包括ORF序列,內(nèi)含子外顯子,啟動子,3'UTR,5'UTR,以及調(diào)控區(qū); ORF:在mRNA上從起始密碼子到終止密碼子之間的一段序列,該段序列可能編碼蛋白質(zhì),也可能不編碼; CDS:能翻譯成氨基酸序列的DNA序列,從起始密碼子到終止密碼子,也就是說CDS與所翻譯的氨基酸序列存在嚴(yán)格的3對1的關(guān)系; mRNA:基因轉(zhuǎn)錄后加工成熟用于翻譯蛋白質(zhì)的序列,包括ORF(此時ORF與CDS相同)序列,3'UTR,5'UTR,5'帽子及3'Poly (A)尾; hnRNA:核不均一RNA,是指轉(zhuǎn)錄獲得的最原始序列,沒有經(jīng)過任何加工,序列包含從轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)到轉(zhuǎn)錄終止位點(diǎn)的全部序列; cDNA:通過mRNA反轉(zhuǎn)錄所得,與mRNA序列互補(bǔ)的單鏈DNA或者與mRNA對應(yīng)的DNA雙鏈; EST:表達(dá)序列標(biāo)簽,是指從一個隨機(jī)選擇的cDNA 克隆,進(jìn)行5’端和3’端單一次測序挑選出來獲得的短的cDNA 部分序列,代表一個完整基因的一小部分,在數(shù)據(jù)庫中其長度一般從20 到7000bp 不等,平均長度為360 ±120bp。由于cDNA文庫的復(fù)雜性和測序的隨機(jī)性,有時多個EST代表同一基因或基因組,將其歸類形成EST簇(EST cluster); 幾者關(guān)系: 1、DNA就是表示一段脫氧核糖核酸序列; 2、包含關(guān)系:gene ∈ genome;EST ∈ cDNA;CDS ∈ ORF;mRNA ∈ hnRNA 說明:基因組上包含若干基因,不多說;一段mRNA上可能包含很多個ORF(只要是以起始密碼子開始,終止密碼子結(jié)束),但是只有能翻譯成蛋白質(zhì)的ORF才能稱之為CDS;EST序列是在隨機(jī)測序過程中獲得的cDNA序列的一部分;hnRNA需要經(jīng)過加工,生成成熟的功能RNA,一條hnRNA可能加工成多條mRNA,也有可能不加工成mRNA而是其他功能RNA,如rRNA,tRNA,核酶等; 3、映射關(guān)系:mRNA & cDNA mRNA與cDNA單鏈互補(bǔ),且A與U互補(bǔ) |
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