 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1352 | 回復(fù): 4 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
[求助]
請問哪位大神會用R軟件計算微生物多樣性指數(shù)？ 已有1人參與
|
|||
|
請問哪位大神會用R軟件計算微生物多樣性指數(shù)？我的一些高通量實驗數(shù)據(jù)想做一些特殊的分析，為此需要學(xué)習(xí)一下用R軟件計算微生物多樣性指數(shù)， 請會做的大神把詳細的過程寫給我好嗎？非常感謝！ |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 高通量測序 |
» 猜你喜歡
求b區(qū)院校調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
材料與化工考研調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
347求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
總分293求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
284求調(diào)劑
已經(jīng)有15人回復(fù)
-
359求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
各位老師您好：本人初試372分
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
285求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
282求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 多樣性指數(shù)表征的是什么？
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 做土壤微生物樣品的16s rDNA pcr 為什么會出現(xiàn)兩條帶？？引物27f 1492r
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 請教T-RFLP的數(shù)據(jù)分析方法？
已經(jīng)有25人回復(fù)
- 求教生物多樣性分析中稀有度曲線的詳細做法及軟件，謝謝！
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 請教微生物群落多樣性指數(shù)分析
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 細菌引物 338F 518R 做DGGE之后 pcr
已經(jīng)有9人回復(fù)
- PCR-DGGE的引物設(shè)計
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 生物信息學(xué)專題－生物版，醫(yī)學(xué)版和信息科學(xué)版共同創(chuàng)建
已經(jīng)有87人回復(fù)
【答案】應(yīng)助回帖
|
otu=read.table("otu.txt",header=T) otu=otu.matrix(otu) #將數(shù)據(jù)類型轉(zhuǎn)化為矩陣 Shannon.Wiener <- diversity(otu,index="shannon"  #計算香農(nóng)指數(shù)Simpson <- diversity(otu,index="simpson" Inverse.Simpson <- diversity(otu,index="inv" S <- specnumber(otu) #計算物種累計數(shù) plot(S) J <- Shannon.Wiener/log(S) #計算Pielou均勻度指數(shù) J |
3樓2015-07-06 09:56:13
【答案】應(yīng)助回帖
|
library(vegan) otu=read.table("otu.txt",header=T) otu=otu.matrix(otu)#將數(shù)據(jù)類型轉(zhuǎn)化為矩陣 Shannon.Wiener <- diversity(otu,index="shannon" #計算香農(nóng)指數(shù)Simpson <- diversity(otu,index="simpson" Inverse.Simpson <- diversity(otu,index="inv" S <- specnumber(otu)#計算物種累計數(shù) plot(S) J <- Shannon.Wiener/log(S) #計算Pielou均勻度指數(shù) J |
2樓2015-07-06 09:54:17
4樓2015-07-06 09:57:14
tanglianfa
金蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 2367
- 散金: 1380
- 紅花: 2
- 沙發(fā): 1
- 帖子: 1316
- 在線: 107.1小時
- 蟲號: 14961324
- 注冊: 2019-04-26
- 性別: GG
- 專業(yè): 環(huán)境工程
5樓2021-05-15 11:22:42
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0854電子信息求調(diào)劑 324 +4 | Promise-jyl 2026-03-23 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料調(diào)劑 +3 | iwinso 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工調(diào)劑 +9 | A-哆啦Z夢 2026-03-23 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。 +4 | 晨昏線與星海 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 07化學(xué)280分求調(diào)劑 +7 | 722865 2026-03-23 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 化學(xué)調(diào)劑 +6 | yzysaa 2026-03-21 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑，一志愿:南京航空航天大學(xué)大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩，總分289分 +6 | @taotao 2026-03-19 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0854AI CV方向招收調(diào)劑 +3 | 章小魚567 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 344求調(diào)劑 +3 | desto 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿河北工業(yè)大學(xué)0817化工278分求調(diào)劑 +7 | jhybd 2026-03-23 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 361求調(diào)劑 +3 | Glack 2026-03-22 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +6 | 87639 2026-03-21 | 10/500 |
|
|
|
[基金申請] 山東省面上項目限額評審 +4 | 石瑞0426 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿南大，0703化學(xué)，分?jǐn)?shù)336，求調(diào)劑 +3 | 收到VS 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿重慶大學(xué)085700資源與環(huán)境總分308求調(diào)劑 +7 | 墨墨漠 2026-03-20 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿武漢理工材料工程專碩調(diào)劑 +9 | Doleres 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 317求調(diào)劑 +5 | 申子申申 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 295材料求調(diào)劑，一志愿武漢理工085601專碩 +5 | Charlieyq 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿西安交通大學(xué) 學(xué)碩 354求調(diào)劑211或者雙一流 +3 | 我想要讀研究生 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿福大288有機化學(xué)，求調(diào)劑 +3 | 小木蟲200408204 2026-03-18 | 3/150 |
|