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如何計(jì)算分子間的弱相互作用以及分析氫鍵 已有2人參與
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如題 如何計(jì)算分子間的弱相互作用以及分析氫鍵 大家好,最近我在用gaussian軟件計(jì)算分子間的相互作用,但是對(duì)于操作步驟現(xiàn)在還是不太確定是不是正確的,所以向各位大牛詳細(xì)請(qǐng)教一下。 現(xiàn)在我把我的計(jì)算步驟詳細(xì)說一下 1)比如兩個(gè)分子,分別稱為分子A和分子B,兩個(gè)分子之間會(huì)形成氫鍵作用 2)我用gaussian軟件用B3LYP/6-311+G*基組分別計(jì)算了只有分子A存在的能量E(A)、只有分子B存在的能量E(B)以及同時(shí)存在兩個(gè)分子(即分子A和分子B)的能量E(AB) 3)最后計(jì)算 認(rèn)為E(AB)-E(A)-E(B)的絕對(duì)值是分子間的弱相互作用, 這樣的計(jì)算方法對(duì)不對(duì),還是說要加上BSSE修正E(BSSE)就行了 即|E(AB)-E(A)-E(B)|+E(BSSE) 請(qǐng)大家不吝賜教,在此謝謝大家了 |
gaussian資源 |

版主 (著名寫手)
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B3LYP算氫鍵并不那么合用(參見“亂談DFT-D”:http://sobereva.com/83),如果起點(diǎn)不高,計(jì)算結(jié)果很難說。 不知分子體系有多大。最起碼要用b97d。最好用DFT-D。如果氫鍵體系較小,可以用mp4(sdtq)或者CCSD。 |
金蟲 (小有名氣)
| 需要BSSE校正,具體的弱相互作用分析方法可以參看此貼http://www.gaoyang168.com/html/201408/7827455.html;使用過這里面的RDG方法,感覺挺形象的,你可以試試。 |


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