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watcher0821新蟲 (初入文壇)
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[求助]
關(guān)于ZINC數(shù)據(jù)庫下載小分子進(jìn)行對(duì)接的問題 已有3人參與
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| 我是虛擬篩選的初級(jí)選手，想請(qǐng)教一下有經(jīng)驗(yàn)的大俠們，我在ZINC數(shù)據(jù)庫中的lead-like和fragment-like里下載的小分子，是一個(gè)mol2文件中有無數(shù)個(gè)小分子，我提取50個(gè)小分子保存在一個(gè)mol2文件里，在AUTODOCK里面對(duì)接報(bào)錯(cuò)，打算對(duì)接600個(gè)小分子又不可能一個(gè)一個(gè)的保存，我是不是應(yīng)該把有多個(gè)小分子的文件轉(zhuǎn)化成一個(gè)文件里只有一個(gè)小分子的格式，該用什么轉(zhuǎn)化怎么轉(zhuǎn)換，謝謝啦~ |
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 autodock |
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【答案】應(yīng)助回帖
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你好！autodock目前為止，似乎還不能處理多個(gè)小分子的對(duì)接，要一個(gè)一個(gè)的處理，可以選擇自己寫腳本或者換軟件對(duì)接。當(dāng)然也有可能我不知道怎么對(duì)接多個(gè)。 [ 發(fā)自小木蟲客戶端 ] |
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watcher08212樓2015-07-22 23:58:15
【答案】應(yīng)助回帖
商家已經(jīng)主動(dòng)聲明此回帖可能含有宣傳內(nèi)容| 處理好后，用Vina做虛擬篩選，autodock不能用于虛擬 |
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3樓2015-07-24 10:52:21
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4樓2015-09-15 16:56:32
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7樓2017-10-29 09:59:01
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