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watcher0821新蟲 (初入文壇)
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[求助]
關(guān)于ZINC數(shù)據(jù)庫下載小分子進行對接的問題 已有3人參與
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| 我是虛擬篩選的初級選手,想請教一下有經(jīng)驗的大俠們,我在ZINC數(shù)據(jù)庫中的lead-like和fragment-like里下載的小分子,是一個mol2文件中有無數(shù)個小分子,我提取50個小分子保存在一個mol2文件里,在AUTODOCK里面對接報錯,打算對接600個小分子又不可能一個一個的保存,我是不是應(yīng)該把有多個小分子的文件轉(zhuǎn)化成一個文件里只有一個小分子的格式,該用什么轉(zhuǎn)化怎么轉(zhuǎn)換,謝謝啦~ |
autodock |
新蟲 (初入文壇)
金蟲 (正式寫手)
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你好!autodock目前為止,似乎還不能處理多個小分子的對接,要一個一個的處理,可以選擇自己寫腳本或者換軟件對接。當(dāng)然也有可能我不知道怎么對接多個。 [ 發(fā)自小木蟲客戶端 ] |
商家已經(jīng)主動聲明此回帖可能含有宣傳內(nèi)容| 處理好后,用Vina做虛擬篩選,autodock不能用于虛擬 |
新蟲 (初入文壇)
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