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watcher0821新蟲 (初入文壇)
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[求助]
關(guān)于ZINC數(shù)據(jù)庫下載小分子進(jìn)行對接的問題 已有3人參與
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| 我是虛擬篩選的初級選手，想請教一下有經(jīng)驗的大俠們，我在ZINC數(shù)據(jù)庫中的lead-like和fragment-like里下載的小分子，是一個mol2文件中有無數(shù)個小分子，我提取50個小分子保存在一個mol2文件里，在AUTODOCK里面對接報錯，打算對接600個小分子又不可能一個一個的保存，我是不是應(yīng)該把有多個小分子的文件轉(zhuǎn)化成一個文件里只有一個小分子的格式，該用什么轉(zhuǎn)化怎么轉(zhuǎn)換，謝謝啦~ |
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 autodock |
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【答案】應(yīng)助回帖
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你好！autodock目前為止，似乎還不能處理多個小分子的對接，要一個一個的處理，可以選擇自己寫腳本或者換軟件對接。當(dāng)然也有可能我不知道怎么對接多個。 [ 發(fā)自小木蟲客戶端 ] |
watcher08212樓2015-07-22 23:58:15
【答案】應(yīng)助回帖
商家已經(jīng)主動聲明此回帖可能含有宣傳內(nèi)容| 處理好后，用Vina做虛擬篩選，autodock不能用于虛擬 |
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3樓2015-07-24 10:52:21
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4樓2015-09-15 16:56:32
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是噠 5樓2015-09-15 16:56:55
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8樓2017-12-03 18:30:11
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9樓2017-12-03 18:34:11
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