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用vasp優(yōu)化晶胞的幾點(diǎn)疑問
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在說我的問題前，我先講講我是怎么優(yōu)化晶胞的：首先我的incar和kpoints中參數(shù)設(shè)置是來自于文獻(xiàn)的，所以我從一開始就設(shè)置了文獻(xiàn)給出的k點(diǎn)，而沒有一步步提高k點(diǎn)。而ENCUT的值同一個(gè)體系，有的作者用的是600eV，有的用的是800eV，不知道用哪個(gè)好？我的優(yōu)化步驟是按源資培訓(xùn)里面介紹的來做的，i：優(yōu)化晶胞參數(shù) ISIF=3，固定原子位置（即在POSCAR文件中原子坐標(biāo)后加F） ii：原子弛豫 ISIF=2 ，不固定原子位置（默認(rèn)是不加F的，即T） iii：用vasp算一般結(jié)構(gòu)都是對稱性降為P1，最后算完將CONTCAR用ms打開，通過find sysmery--impose sysmetry恢復(fù)對稱性 以下是我的問題： ①我的這個(gè)優(yōu)化過程可行嗎 ②第一步的時(shí)候我不確定到什么時(shí)候停止，就把contcar變?yōu)閜oscar重復(fù)第一步的計(jì)算，最近有一個(gè)我重復(fù)了20次，最后晶胞參數(shù)和總能量都不再變化了，然后我就進(jìn)行原子弛豫，發(fā)現(xiàn)晶胞參數(shù)和總能量還是不變，我就不知道我這樣做對不對，感覺重復(fù)太多次了。應(yīng)該有一個(gè)什么標(biāo)準(zhǔn)來停止晶胞參數(shù)的優(yōu)化這一步呢？我知道的就是看最護(hù)兩步的總能量和晶胞參數(shù)基本一樣，但有沒有一個(gè)什么標(biāo)準(zhǔn)呢？跟incar中設(shè)置的EDIFF和EDIFFG有關(guān)嗎? ③excel中我會列入external pressure是看到文獻(xiàn)的一句話 （見圖） ，不知是不是指的是最后優(yōu)化總壓力小于+-0.5KB,這個(gè)需不需要考慮到優(yōu)化是否收斂中來？ ④關(guān)于poscar也就是建模的問題，文獻(xiàn)中有兩種數(shù)據(jù)，一種是實(shí)驗(yàn)測得的晶胞參數(shù)和原子坐標(biāo)，一種是別人理論計(jì)算優(yōu)化好的晶胞參數(shù)和原子坐標(biāo)，使用哪種數(shù)據(jù)建模更合適呢？ DN}RHRJ@JIY6)14~{[AFJUF.png RKRX]Q1Q2F`%IC}0{H{@`NB.png |
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
xiewei娜: 金幣+5, 謝謝！ 2015-08-24 21:09:58
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xiewei娜: 金幣+5, 謝謝！ 2015-08-24 21:09:58
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樓主問題太詳細(xì)了 從優(yōu)化的角度來說，樓主的思路是對的 一下是我的看法，個(gè)人觀點(diǎn)： 首先 優(yōu)化晶胞參數(shù)，原子位置（這個(gè)一起弄 ISIF=3 對單胞優(yōu)化）——建超胞（ISIF=2）只優(yōu)化位置——設(shè)計(jì)性質(zhì) 不過ENCUT 建議優(yōu)化前還是測試哈 KPOINT可以參考文獻(xiàn)或者經(jīng)驗(yàn)值 |
2樓2015-08-24 20:10:11
3樓2015-08-24 21:08:56
mlanqiang
木蟲之王 (文學(xué)泰斗)
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4樓2015-08-24 21:23:25
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
xiewei娜: 金幣+5 2015-08-25 11:04:53
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xiewei娜: 金幣+5 2015-08-25 11:04:53
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在說我的問題前，我先講講我是怎么優(yōu)化晶胞的：首先我的incar和kpoints中參數(shù)設(shè)置是來自于文獻(xiàn)的，所以我從一開始就設(shè)置了文獻(xiàn)給出的k點(diǎn)，而沒有一步步提高k點(diǎn)。而ENCUT的值同一個(gè)體系，有的作者用的是600eV，有的用的是800eV，不知道用哪個(gè)好？ "那肯定是800eV好！但是這東西要測試，如果600達(dá)到你的精度要求了，就沒必要800了……" 我的優(yōu)化步驟是按源資培訓(xùn)里面介紹的來做的，i：優(yōu)化晶胞參數(shù) ISIF=3，固定原子位置（即在POSCAR文件中原子坐標(biāo)后加F） ii：原子弛豫 ISIF=2 ，不固定原子位置（默認(rèn)是不加F的，即T） iii：用vasp算一般結(jié)構(gòu)都是對稱性降為P1，最后算完將CONTCAR用ms打開，通過find sysmery--impose sysmetry恢復(fù)對稱性 以下是我的問題： ①我的這個(gè)優(yōu)化過程可行嗎②第一步的時(shí)候我不確定到什么時(shí)候停止，就把contcar變?yōu)閜oscar重復(fù)第一步的計(jì)算，最近有一個(gè)我重復(fù)了20次，最后晶胞參數(shù)和總能量都不再變化了，然后我就進(jìn)行原子弛豫，發(fā)現(xiàn)晶胞參數(shù)和總能量還是不變，我就不知道我這樣做對不對，感覺重復(fù)太多次了。應(yīng)該有一個(gè)什么標(biāo)準(zhǔn)來停止晶胞參數(shù)的優(yōu)化這一步呢？我知道的就是看最護(hù)兩步的總能量和晶胞參數(shù)基本一樣，但有沒有一個(gè)什么標(biāo)準(zhǔn)呢？跟incar中設(shè)置的EDIFF和EDIFFG有關(guān)嗎? “姐，你這步驟真詳細(xì)，但是我想，沒有哪個(gè)方法，是通用的方法，對于不同的體系，是有不同的方法的，當(dāng)然，你這個(gè)步驟，應(yīng)該沒有問題，但是真麻煩” ③excel中我會列入external pressure是看到文獻(xiàn)的一句話 （見圖） ，不知是不是指的是最后優(yōu)化總壓力小于+-0.5KB,這個(gè)需不需要考慮到優(yōu)化是否收斂中來？ “這個(gè)不懂……我都是利用EDIFFG控制” ④關(guān)于poscar也就是建模的問題，文獻(xiàn)中有兩種數(shù)據(jù)，一種是實(shí)驗(yàn)測得的晶胞參數(shù)和原子坐標(biāo)，一種是別人理論計(jì)算優(yōu)化好的晶胞參數(shù)和原子坐標(biāo)，使用哪種數(shù)據(jù)建模更合適呢？ “如果你沒有文獻(xiàn)參考，當(dāng)然是用實(shí)驗(yàn)的了。但是有文獻(xiàn)參考，如果方法和你一樣，那當(dāng)然是用文獻(xiàn)的了，但是前提是，文獻(xiàn)一定要可靠，比如PRB一類的，或者是知名學(xué)者的文獻(xiàn)” 以上個(gè)人愚見，僅供參考 |
6樓2015-08-25 08:45:19
| 祝福，，，， |
7樓2015-08-25 08:59:50
8樓2015-08-25 11:02:05
9樓2015-08-25 11:06:11
g_wcai
木蟲 (正式寫手)
開心
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10樓2015-08-25 11:18:11
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