lkd-syl

金蟲 (著名寫手)

船長(zhǎng)

應(yīng)助: 7 (幼兒園)
金幣: 4141.1
散金: 297
紅花: 16
帖子: 1782
在線: 519小時(shí)
蟲號(hào): 2653955
注冊(cè): 2013-09-14
性別: GG
專業(yè): 金屬材料的合金相、相變及

[求助] 動(dòng)力學(xué)跑出這樣的結(jié)構(gòu)，是什么原因啊？已有1人參與

RT，跑鐵的超胞動(dòng)力學(xué)出來(lái)一個(gè)這樣的結(jié)果，感覺是錯(cuò)了，請(qǐng)各位大神分析一下是什么原因，不勝感激，，，
輸入?yún)?shù)：
md conp conse qok nomod pres spat pot efg
ensemble npt
tau_thermostat 0.1 ps
tau_barostat 0.1 ps

temperature 1500.000000 K
pressure 0.000101 GPa

equilibration 10 ps
timestep 2 fs
production 50 ps
write 100
sample 100

title
GULP calculation from Materials Studio for Fe9826
end

cell
48.728800 48.728800 48.728800 90.000000 90.000000 90.000000

fractional
Fe1 core 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.0 1 1 1
Fe1 core 0.029412 0.029412 0.029412 0.000000 1.000000 0.0 1 1 1

輸入的結(jié)果以幾張附圖所示，，，

結(jié)構(gòu).jpg

動(dòng)力學(xué)跑出這樣的結(jié)構(gòu)，是什么原因�。�-1

constant of motion.jpg

動(dòng)力學(xué)跑出這樣的結(jié)構(gòu)，是什么原因啊？-2

pressure.jpg

動(dòng)力學(xué)跑出這樣的結(jié)構(gòu)，是什么原因啊？-3

temperature.jpg

回復(fù)此樓

» 猜你喜歡

一志愿華中科技大學(xué)071000，求調(diào)劑已經(jīng)有3人回復(fù)
279分求調(diào)劑一志愿211 已經(jīng)有14人回復(fù)
332求調(diào)劑已經(jīng)有3人回復(fù)
0856材料專碩353求調(diào)劑已經(jīng)有3人回復(fù)
材料學(xué)學(xué)碩080502 337求調(diào)劑-一志愿華中科技大學(xué) 已經(jīng)有5人回復(fù)
085601調(diào)劑 358分已經(jīng)有4人回復(fù)
0856 271求調(diào)劑已經(jīng)有3人回復(fù)
能源材料化學(xué)課題組招收碩士研究生8-10名已經(jīng)有15人回復(fù)
一志愿西安交通大學(xué)材料工程專業(yè) 282分求調(diào)劑已經(jīng)有9人回復(fù)
一志愿重慶大學(xué)085700資源與環(huán)境總分308求調(diào)劑已經(jīng)有6人回復(fù)

» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:

跑動(dòng)力學(xué)能否優(yōu)化離子團(tuán)簇結(jié)構(gòu)？已經(jīng)有22人回復(fù)
[轉(zhuǎn)載]一個(gè)老貼:一個(gè)局外人看北大數(shù)學(xué)考研初試及數(shù)學(xué)分析學(xué)習(xí)方法--SCIbird 已經(jīng)有11人回復(fù)
學(xué)習(xí)數(shù)學(xué)的“四字訣” 已經(jīng)有20人回復(fù)
分子中電荷變化種種已經(jīng)有82人回復(fù)
CASTEP跑分子動(dòng)力學(xué) 已經(jīng)有12人回復(fù)
趣味心理學(xué)實(shí)驗(yàn) 已經(jīng)有4人回復(fù)
李雙龍：我為什么讀博士已經(jīng)有102人回復(fù)
【求助】小分子跑動(dòng)力學(xué)之前需不需要用高斯優(yōu)化？已經(jīng)有8人回復(fù)

Nothingimpossible�。�

1樓 2015-08-26 16:39:13

已閱關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

pigrass

專家顧問 (著名寫手)

伊卡斯特的小豬

專家經(jīng)驗(yàn): +503
模擬EPI: 4
應(yīng)助: 377 (碩士)
金幣: 10371
散金: 3286
紅花: 166
帖子: 2101
在線: 1968.4小時(shí)
蟲號(hào): 1463681
注冊(cè): 2011-10-27
性別: GG
專業(yè): 高分子材料結(jié)構(gòu)與性能
管轄: 分子模擬

50ps后npt系綜的溫度還有這么大的波動(dòng)，說(shuō)明結(jié)構(gòu)還不穩(wěn)定
如果是覺得原子在盒子“外”比較奇怪，右鍵display style里改in-cell

贊一下

回復(fù)此樓

#有問題發(fā)論壇，不接受私聊#愛晶體，愛MaterialsStudio#MS專輯點(diǎn)擊右邊#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性數(shù)據(jù)#http://webbook.nist.gov/chemistry/#

2樓2015-08-27 08:39:06

已閱關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

lkd-syl

金蟲 (著名寫手)

船長(zhǎng)

應(yīng)助: 7 (幼兒園)
金幣: 4141.1
散金: 297
紅花: 16
帖子: 1782
在線: 519小時(shí)
蟲號(hào): 2653955
注冊(cè): 2013-09-14
性別: GG
專業(yè): 金屬材料的合金相、相變及

引用回帖:

2樓: Originally posted by pigrass at 2015-08-26 12:39:06
50ps后npt系綜的溫度還有這么大的波動(dòng)，說(shuō)明結(jié)構(gòu)還不穩(wěn)定
如果是覺得原子在盒子“外”比較奇怪，右鍵display style里改in-cell

結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定是因?yàn)樵谶@個(gè)原子數(shù)下50ps的時(shí)間不夠嗎？另外原來(lái)“盒子”內(nèi)的原子跑完動(dòng)力學(xué)后成為這樣，感覺像是整體的移動(dòng)，這是不是說(shuō)明已經(jīng)有比較大的問題了呀？

贊一下

回復(fù)此樓

Nothingimpossible��！

3樓2015-08-27 09:47:02

已閱關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

pigrass

專家顧問 (著名寫手)

伊卡斯特的小豬

專家經(jīng)驗(yàn): +503
模擬EPI: 4
應(yīng)助: 377 (碩士)
金幣: 10371
散金: 3286
紅花: 166
帖子: 2101
在線: 1968.4小時(shí)
蟲號(hào): 1463681
注冊(cè): 2011-10-27
性別: GG
專業(yè): 高分子材料結(jié)構(gòu)與性能
管轄: 分子模擬

引用回帖:

3樓: Originally posted by lkd-syl at 2015-08-27 09:47:02
結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定是因?yàn)樵谶@個(gè)原子數(shù)下50ps的時(shí)間不夠嗎？另外原來(lái)“盒子”內(nèi)的原子跑完動(dòng)力學(xué)后成為這樣，感覺像是整體的移動(dòng)，這是不是說(shuō)明已經(jīng)有比較大的問題了呀？...

周期性結(jié)構(gòu)沒有整體移動(dòng)的說(shuō)法，你以為原子“移動(dòng)到外面"了，可是你把display style設(shè)置成incell，你還能看得出移動(dòng)嗎，可能只是顯示問題罷了。除非你看到原先松散排列的都團(tuán)聚到一起，那才是真的移動(dòng)

平衡的方法建議找找文獻(xiàn)，看看別人用的什么勢(shì)函數(shù)，用的什么系綜，另外，原子多的話平衡時(shí)間肯定長(zhǎng)

贊一下

回復(fù)此樓

#有問題發(fā)論壇，不接受私聊#愛晶體，愛MaterialsStudio#MS專輯點(diǎn)擊右邊#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性數(shù)據(jù)#http://webbook.nist.gov/chemistry/#

4樓2015-08-27 11:12:34

已閱關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

15216105346

金蟲 (著名寫手)

應(yīng)助: 13 (小學(xué)生)
金幣: 2062.4
散金: 2693
紅花: 7
帖子: 1205
在線: 298小時(shí)
蟲號(hào): 3441372
注冊(cè): 2014-09-25
專業(yè): 固體無(wú)機(jī)化學(xué)

【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
lkd-syl: 金幣+3, ★有幫助 2015-08-27 19:29:33

個(gè)人感覺，你的勢(shì)參數(shù)有問題！要是用文獻(xiàn)的參數(shù)注意單位換算問題！我曾經(jīng)也有過(guò)這樣的經(jīng)歷

[ 發(fā)自小木蟲客戶端 ]

贊一下

回復(fù)此樓

5樓2015-08-27 18:06:16

已閱關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

lkd-syl

金蟲 (著名寫手)

船長(zhǎng)

應(yīng)助: 7 (幼兒園)
金幣: 4141.1
散金: 297
紅花: 16
帖子: 1782
在線: 519小時(shí)
蟲號(hào): 2653955
注冊(cè): 2013-09-14
性別: GG
專業(yè): 金屬材料的合金相、相變及

引用回帖:

5樓: Originally posted by 15216105346 at 2015-08-26 22:06:16
個(gè)人感覺，你的勢(shì)參數(shù)有問題！要是用文獻(xiàn)的參數(shù)注意單位換算問題！我曾經(jīng)也有過(guò)這樣的經(jīng)歷

請(qǐng)問你的后邊是怎么解決的，這個(gè)也是查閱文獻(xiàn)所引用的，比較粗糙，具體一點(diǎn)就需要擬合新的勢(shì)函數(shù)，，，

贊一下

回復(fù)此樓

Nothingimpossible！！

6樓2015-08-27 19:29:16

已閱關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

lkd-syl

金蟲 (著名寫手)

船長(zhǎng)

應(yīng)助: 7 (幼兒園)
金幣: 4141.1
散金: 297
紅花: 16
帖子: 1782
在線: 519小時(shí)
蟲號(hào): 2653955
注冊(cè): 2013-09-14
性別: GG
專業(yè): 金屬材料的合金相、相變及

引用回帖:

4樓: Originally posted by pigrass at 2015-08-26 15:12:34
周期性結(jié)構(gòu)沒有整體移動(dòng)的說(shuō)法，你以為原子“移動(dòng)到外面"了，可是你把display style設(shè)置成incell，你還能看得出移動(dòng)嗎，可能只是顯示問題罷了。除非你看到原先松散排列的都團(tuán)聚到一起，那才是真的移動(dòng)

平衡 ...

恩，原來(lái)我也是感覺看著不舒服而已，我再調(diào)整一下試試，，，，

贊一下

回復(fù)此樓

Nothingimpossible�。�

7樓2015-08-27 19:30:38

已閱關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

最具人氣熱帖推薦 [查看全部]	作者	回/看	最后發(fā)表

[考研] 一志愿華中科技大學(xué)071000，求調(diào)劑 +3	沿岸有貝殼6 2026-03-21	3/150	2026-03-21 10:35 by 暮云清寒
[考研] 332求調(diào)劑 +3	鳳凰院丁真 2026-03-20	3/150	2026-03-21 10:27 by luoyongfeng
[考研] 268求調(diào)劑 +7	簡(jiǎn)單點(diǎn)0 2026-03-17	7/350	2026-03-21 08:32 by JourneyLucky
[考研] 306求調(diào)劑 +4	chuanzhu川燭 2026-03-18	4/200	2026-03-21 08:25 by laoshidan
[考研] 一志愿蘇州大學(xué)材料求調(diào)劑，總分315（英一） +5	sbdksD 2026-03-19	5/250	2026-03-20 22:10 by luoyongfeng
[考研] 一志愿西南交通專碩材料355 本科雙非求調(diào)劑 +5	西南交通專材355 2026-03-19	5/250	2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[基金申請(qǐng)] 學(xué)校已經(jīng)提交到NSFC，還能修改嗎？ 40+4	babangida 2026-03-19	8/400	2026-03-20 15:58 by babero
[考研] 286分人工智能專業(yè)請(qǐng)求調(diào)劑愿意跨考！ +3	lemonzzn 2026-03-17	4/200	2026-03-20 11:04 by lemonzzn
[考研] 求調(diào)劑 +3	暗涌afhb 2026-03-16	3/150	2026-03-20 00:28 by 河南大學(xué)校友
[考研] 材料學(xué)碩318求調(diào)劑 +5	February_Feb 2026-03-19	5/250	2026-03-19 23:51 by 23Postgrad
[考研] 288求調(diào)劑，一志愿華南理工大學(xué)071005 +5	ioodiiij 2026-03-17	5/250	2026-03-19 18:22 by zcl123
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +5	pupcoco 2026-03-17	8/400	2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 一志愿985，本科211，0817化學(xué)工程與技術(shù)319求調(diào)劑 +10	Liwangman 2026-03-15	10/500	2026-03-19 10:25 by 無(wú)際的草原
[考研] 312求調(diào)劑 +8	陌宸希 2026-03-16	9/450	2026-03-18 12:39 by Linda Hu
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +3	妮妮ninicgb 2026-03-17	3/150	2026-03-18 10:29 by macy2011
[考研] 生物學(xué)071000 329分求調(diào)劑 +3	我愛生物生物愛?/a> 2026-03-17	3/150	2026-03-18 10:12 by macy2011
[考研] 290求調(diào)劑 +3	p asserby. 2026-03-15	4/200	2026-03-17 16:35 by wangkm
[考研] 考研調(diào)劑 +3	淇ya_~ 2026-03-17	5/250	2026-03-17 09:25 by Winj1e
[考研] 11408 一志愿西電，277分求調(diào)劑 +3	zhouzhen654 2026-03-16	3/150	2026-03-17 07:03 by laoshidan
[考研] 機(jī)械專碩325，尋找調(diào)劑院校 +3	y9999 2026-03-15	5/250	2026-03-16 19:58 by y9999