 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1619 | 回復(fù): 2 | ||
[求助]
MOE全新藥物分子設(shè)計，請賜教！
|
| 用MOE做全新藥物設(shè)計，有些問題不太明白：1，在fragments模塊的scaffold R replacement中，OK后彈出vectors of wrong length，為啥？而將scoring 改成NONE后又會有些片段生成。。。2， fragment模塊是將數(shù)據(jù)庫中保存的整個片段對接到口袋部位？還是有連接不同片段或具有生長的功能？ 3，另外，打開的蛋白配體復(fù)合物，其Electrostatic Map 顯示的口袋的信息會根據(jù)不同的配體而變化嗎？還是因為口袋有伸縮的功能或和配體相互作用后引起氨基酸位置等變化？HELP中的教程好像不全，各位有好的教程，望指教！ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
[求助] 流式死活染 & 單細(xì)胞門控設(shè)置被質(zhì)疑，如何優(yōu)化并解釋？
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
蛋白穩(wěn)定性實驗與功能實驗不一致
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
藥物學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有203人回復(fù)
-
第4年了，馬上40了，可能我與國基確實無緣吧。。。
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
關(guān)于SCI雜志發(fā)表掛名
已經(jīng)有32人回復(fù)
-
2026年申博藥學(xué)專業(yè)
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
藥學(xué)專碩申博
已經(jīng)有1人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
2樓2015-12-07 10:07:29
|
樓主，您好。最近我也剛開始學(xué)MOE，有幾個問題想向您請教。我現(xiàn)在已經(jīng)有了片段化合物與蛋白的復(fù)合物結(jié)構(gòu)，我想對片段進(jìn)行后續(xù)優(yōu)化，不知道該怎么進(jìn)行，煩請樓主賜教。 我的想法是：（1）直接在接觸界面對分子添加Build，然后minize,找出能提高affinity的分子。這樣盲目性比較大，而且我想知道添加Build模塊后，軟件會不會進(jìn)行蛋白+化合物的整體能量計算？（2）利用compute里面的fragment板塊，可以進(jìn)行片段生長，這里我的問題是，如何讓分子生長到口袋里去，而不是隨機(jī)延伸。因為不專業(yè)，問的可能有問題。如果樓主有更好的建議或者操作方法，將不勝感激。期待您的回復(fù)。 |
3樓2018-06-11 16:47:56
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 小力xiaoli 的主題更新
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑，求各位老師收留 +9 | 秋有木北 2026-03-14 | 9/450 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿武理材料305分求調(diào)劑 +5 | 想上岸的鯉魚 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿985，本科211，0817化學(xué)工程與技術(shù)319求調(diào)劑 +6 | Liwangman 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 280求調(diào)劑 +6 | 咕嚕曉曉 2026-03-18 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 278求調(diào)劑 +5 | 煙火先于春 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 277調(diào)劑 +5 | 自由煎餅果子 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 考研化學(xué)學(xué)碩調(diào)劑，一志愿985 +4 | 張vvvv 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工求調(diào)劑 +5 | 緒幸與子 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 有沒有道鐵/土木的想調(diào)劑南林，給自己招師弟中～ +3 | TqlXswl 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿蘇州大學(xué)材料工程（085601）專碩有科研經(jīng)歷三項國獎兩個實用型專利一項省級立項 +6 | 大火山小火山 2026-03-16 | 8/400 |
|
|
|
[考博] 26申博 +4 | 八旬速覽 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 275求調(diào)劑 +4 | 太陽花天天開心 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 274求調(diào)劑 +5 | 時間點 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +4 | ahbd 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +3 | 劉夢微 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 26考研一志愿中國石油大學(xué)(華東)305分求調(diào)劑 +3 | 嘉年新程 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 294求調(diào)劑 +3 | Zys010410@ 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 308 085701 四六級已過求調(diào)劑 +7 | 溫喬喬喬喬 2026-03-12 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 328化工專碩求調(diào)劑 +4 | 。，。，。，。i 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考博] 福州大學(xué)楊黃浩課題組招收2026年專業(yè)學(xué)位博士研究生，2026.03.20截止 +3 | Xiangyu_ou 2026-03-12 | 3/150 |
|