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wyysunshine木蟲 (知名作家)
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[求助]
Modeltest尋找建樹模型求助~~ 已有3人參與
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正在做DNA序列分析，用到modeltest尋找建樹模型，操作步驟如下：（參考http://blog.sina.com.cn/s/blog_43b74ed60100dexh.html） 1、把序列使用ClustalX 1.83進行比對，然后保存成PAUP識別的格式Nexus，然后導(dǎo)入至PAUP。 2、導(dǎo)入序列之后，在Modeltest的文件夾中，有一個paupblock的文件夾，里面有一個文件叫“modelblockPAUPb10”，然后在paup軟件中，file，open，就可以執(zhí)行這個命令了。就是paup用ML計算不同model下的似然值。如果序列比較多，且長的話，需要計算一陣呢！ 3、運行完這步之后，在paupblock文件夾中，會生成一個名為“model.scores”的文件。 4、安裝MrMTgui，完成之后，打開界面，在下面會有MT path和PAUP path兩個按鈕，然后打開，找到Modeltest和paup所在的文件夾，雙擊他們的安裝程序，就可以連接上兩個軟件了。 5、然后點擊左邊的按鈕“select file”，找到“model.scores”，之后，點擊按鈕“Modeltest！！”，然后就會出現(xiàn)運行結(jié)果了。 6、會出現(xiàn)兩個運行結(jié)果，一個是hLRT得出的結(jié)果，另一個是AIC給出的結(jié)果。 問題出在第5步，點擊‘modeltest�。 �，就出現(xiàn)了下面的提示，Execution of command ‘m.bat’ failed （error 2：the system cannot find the file specified.） 好像是說一個文件找不到，但我并沒有改動文件夾里的東西啊，運行了好幾次都是這樣，不知道問題出在哪里  help me plz modeltest.jpg |
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8樓2015-12-24 14:07:36
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9樓2015-12-28 21:36:51
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2樓2015-12-04 08:16:21
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4樓2015-12-18 20:14:13
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5樓2015-12-18 21:14:27
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6樓2015-12-18 23:12:55
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