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wyysunshine木蟲 (知名作家)
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[求助]
Modeltest尋找建樹模型求助~~ 已有3人參與
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正在做DNA序列分析,用到modeltest尋找建樹模型,操作步驟如下:(參考http://blog.sina.com.cn/s/blog_43b74ed60100dexh.html) 1、把序列使用ClustalX 1.83進行比對,然后保存成PAUP識別的格式Nexus,然后導(dǎo)入至PAUP。 2、導(dǎo)入序列之后,在Modeltest的文件夾中,有一個paupblock的文件夾,里面有一個文件叫“modelblockPAUPb10”,然后在paup軟件中,file,open,就可以執(zhí)行這個命令了。就是paup用ML計算不同model下的似然值。如果序列比較多,且長的話,需要計算一陣呢! 3、運行完這步之后,在paupblock文件夾中,會生成一個名為“model.scores”的文件。 4、安裝MrMTgui,完成之后,打開界面,在下面會有MT path和PAUP path兩個按鈕,然后打開,找到Modeltest和paup所在的文件夾,雙擊他們的安裝程序,就可以連接上兩個軟件了。 5、然后點擊左邊的按鈕“select file”,找到“model.scores”,之后,點擊按鈕“Modeltest。 ,然后就會出現(xiàn)運行結(jié)果了。 6、會出現(xiàn)兩個運行結(jié)果,一個是hLRT得出的結(jié)果,另一個是AIC給出的結(jié)果。 問題出在第5步,點擊‘modeltest!’之后,就出現(xiàn)了下面的提示,Execution of command ‘m.bat’ failed (error 2:the system cannot find the file specified.) 好像是說一個文件找不到,但我并沒有改動文件夾里的東西啊,運行了好幾次都是這樣,不知道問題出在哪里 ![]() ![]() ![]() help me plz ![]() ![]() ![]() modeltest.jpg |

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