 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 10033 | 回復(fù): 32 | |||
| 【獎勵】 本帖被評價17次，作者kgoing增加金幣 12.8 個 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
[資源]
如何在天河二號上安裝Material Studio軟件
|
|||
|
做過模擬計算的同仁，應(yīng)該對于Material Studio軟件比較熟悉，尤其是該軟件友好的界面，是優(yōu)秀的前處理以及后處理軟件之一。但該軟件常用的模塊Castep/Dmol/Forcite的并行效率并不高，即使對于linux版（更不用說Windows版），我想諸君都很少用到百核以上。因此，今天跟大家分享一下如何利用超算（目前運行最快的天河二號為例）的分布式系統(tǒng)，突破并行核數(shù)以及內(nèi)存的限制。 如果大家有該軟件版權(quán)的話，不妨根據(jù)附件的安裝文檔，自己嘗試安裝。MS常用的版本包括60/70/80，安裝以及使用的方法則是大同小異，我已經(jīng)將安裝文檔、腳本（針對天河二號的SLUERM系統(tǒng)）以及相關(guān)的文件（支持高速網(wǎng)的庫文件）添加到附件中，大家可以結(jié)合安裝文檔的內(nèi)容去使用其他附件。同時建議大家安裝成功以后一定要進(jìn)行正確性測試，用自己熟悉的算例結(jié)果去比對。 在此，需要分享的一個經(jīng)驗的是，雖然天河二號的收費方式是以一個結(jié)點為計算單元（一個結(jié)點24核，即用1核和用24個核是一樣的收費方式），但并不一定每個算例用滿一個結(jié)點CPU物理核的性能最好（舉個例子：任務(wù)量一定，過多CPU物理核的參與，會把時間浪費在協(xié)調(diào)上），如果不太清楚自己算例的情況，可以做擴(kuò)展性測試，從1、2、4、8、16...核數(shù)一直往上測執(zhí)行時間，在時間曲線的拐點附近尋找最優(yōu)核數(shù)。 PS：有問題的蟲友，請給我留言，如果相關(guān)內(nèi)容有問題，我會及時更新。。 |
回復(fù)此樓» 本帖附件資源列表
-
歡迎監(jiān)督和反饋：小木蟲僅提供交流平臺，不對該內(nèi)容負(fù)責(zé)。
本內(nèi)容由用戶自主發(fā)布，如果其內(nèi)容涉及到知識產(chǎn)權(quán)問題，其責(zé)任在于用戶本人，如對版權(quán)有異議，請聯(lián)系郵箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : MS_lib.tar.gz
- 附件 2 : 如何在天河二號上安裝MS.pdf
- 附件 3 : sub_script.tar.gz
2016-03-17 17:48:13, 28.33 M
2016-03-17 17:48:21, 404.59 K
2016-03-21 15:06:26, 713 bytes
» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 NWCHEM |
» 猜你喜歡
請問還有沒有用Latex寫文章的小伙伴們？
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
光學(xué)工程學(xué)碩調(diào)劑信息
已經(jīng)有32人回復(fù)
-
物理學(xué)I論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有284人回復(fù)
-
歡迎加入課題組
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
散金幣，求好運，祝面上順利！
已經(jīng)有78人回復(fù)
-
華東師范大學(xué)芯片設(shè)計徐瓏真實水平咋樣
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
調(diào)劑
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
【新加坡】納米電子器件項目組有“聯(lián)合培養(yǎng)博士生”名額
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
中德博士后2026項目5月30日截止- 國內(nèi)博士后入站、德國兩年全職
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
面向全球申請人的中德博士后2026項目5月30日截止- 國內(nèi)博后入站德國兩年全職
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
【新加坡】納米電子器件項目組有“聯(lián)合培養(yǎng)博士生”名額
已經(jīng)有2人回復(fù)
6樓2016-04-30 23:13:12
2樓2016-03-23 20:41:41
★★★★★ 五星級,優(yōu)秀推薦
|
使用廣州天河二號進(jìn)行castep計算，當(dāng)選用HSE06計算帶隙時出現(xiàn)如下錯誤!（MS版本為7.0） ERROR: Shifted MP set detected/supplied - unshifted MP k-point set required for an NLXC calculation Current trace stack: nlxc_basis_initialise_complex nlxc_basis_initialise nlxc_initialise castep 煩請樓主指導(dǎo)！  |
3樓2016-04-08 19:13:00
8樓2016-06-23 18:06:10
簡單回復(fù)
sunpixel4樓
2016-04-09 07:02
回復(fù)
2016-04-09 20:53
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
書蟲呆呆7樓
2016-05-20 14:28
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
xiaozhigang11樓
2017-01-16 10:15
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
saphy12樓
2017-03-13 18:36
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
hdlghzb14樓
2017-03-16 14:42
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 生物學(xué)學(xué)碩求調(diào)劑 +5 | 小羊睡著了? 2026-03-23 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +5 | 某某某某位 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿河北工業(yè)大學(xué)0817化工278分求調(diào)劑 +7 | jhybd 2026-03-23 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 279分求調(diào)劑 一志愿211 +17 | chaojifeixia 2026-03-19 | 19/950 |
|
|
|
[考研] 化學(xué)308分求調(diào)劑 +3 | 你好明天你好 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 工科材料085601 279求調(diào)劑 +8 | 困于星晨 2026-03-17 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 求老師收我 +3 | zzh16938784 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 352求調(diào)劑 +3 | 大米飯！ 2026-03-22 | 3/150 |
|
|
|
[考研]
 一志愿東華大學(xué)化學(xué)070300，求調(diào)劑
+7
|
2117205181 2026-03-21 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 308求調(diào)劑 +3 | 墨墨漠 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 298求調(diào)劑一志愿211 +3 | 上岸6666@ 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 280求調(diào)劑 +11 | 咕嚕曉曉 2026-03-18 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 一志愿深大，0703化學(xué)，總分302，求調(diào)劑 +4 | 七月-七七 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 296求調(diào)劑 +4 | www_q 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 266求調(diào)劑 +3 | 哇呼哼呼哼 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +3 | wyyyqx 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 初始318分求調(diào)劑（有工作經(jīng)驗） +3 | 1911236844 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +4 | ydfyh 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料 336 求調(diào)劑 +3 | An@. 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿西南交大，求調(diào)劑 +5 | 材化逐夢人 2026-03-18 | 5/250 |
|