 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 33 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 10035 | 回復(fù): 32 | |||
| 【獎勵】 本帖被評價17次，作者kgoing增加金幣 12.8 個 | |||
[資源]
如何在天河二號上安裝Material Studio軟件
|
|||
|
做過模擬計算的同仁，應(yīng)該對于Material Studio軟件比較熟悉，尤其是該軟件友好的界面，是優(yōu)秀的前處理以及后處理軟件之一。但該軟件常用的模塊Castep/Dmol/Forcite的并行效率并不高，即使對于linux版（更不用說Windows版），我想諸君都很少用到百核以上。因此，今天跟大家分享一下如何利用超算（目前運行最快的天河二號為例）的分布式系統(tǒng)，突破并行核數(shù)以及內(nèi)存的限制。 如果大家有該軟件版權(quán)的話，不妨根據(jù)附件的安裝文檔，自己嘗試安裝。MS常用的版本包括60/70/80，安裝以及使用的方法則是大同小異，我已經(jīng)將安裝文檔、腳本（針對天河二號的SLUERM系統(tǒng)）以及相關(guān)的文件（支持高速網(wǎng)的庫文件）添加到附件中，大家可以結(jié)合安裝文檔的內(nèi)容去使用其他附件。同時建議大家安裝成功以后一定要進行正確性測試，用自己熟悉的算例結(jié)果去比對。 在此，需要分享的一個經(jīng)驗的是，雖然天河二號的收費方式是以一個結(jié)點為計算單元（一個結(jié)點24核，即用1核和用24個核是一樣的收費方式），但并不一定每個算例用滿一個結(jié)點CPU物理核的性能最好（舉個例子：任務(wù)量一定，過多CPU物理核的參與，會把時間浪費在協(xié)調(diào)上），如果不太清楚自己算例的情況，可以做擴展性測試，從1、2、4、8、16...核數(shù)一直往上測執(zhí)行時間，在時間曲線的拐點附近尋找最優(yōu)核數(shù)。 PS：有問題的蟲友，請給我留言，如果相關(guān)內(nèi)容有問題，我會及時更新。。 |
回復(fù)此樓» 本帖附件資源列表
-
歡迎監(jiān)督和反饋：小木蟲僅提供交流平臺，不對該內(nèi)容負(fù)責(zé)。
本內(nèi)容由用戶自主發(fā)布，如果其內(nèi)容涉及到知識產(chǎn)權(quán)問題，其責(zé)任在于用戶本人，如對版權(quán)有異議，請聯(lián)系郵箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : MS_lib.tar.gz
- 附件 2 : 如何在天河二號上安裝MS.pdf
- 附件 3 : sub_script.tar.gz
2016-03-17 17:48:13, 28.33 M
2016-03-17 17:48:21, 404.59 K
2016-03-21 15:06:26, 713 bytes
» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 NWCHEM |
» 猜你喜歡
光學(xué)工程學(xué)碩調(diào)劑信息
已經(jīng)有32人回復(fù)
-
歡迎加入課題組
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
物理學(xué)I論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有222人回復(fù)
-
散金幣，求好運，祝面上順利！
已經(jīng)有78人回復(fù)
-
華東師范大學(xué)芯片設(shè)計徐瓏真實水平咋樣
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
調(diào)劑
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
【新加坡】納米電子器件項目組有“聯(lián)合培養(yǎng)博士生”名額
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
中德博士后2026項目5月30日截止- 國內(nèi)博士后入站、德國兩年全職
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
面向全球申請人的中德博士后2026項目5月30日截止- 國內(nèi)博后入站德國兩年全職
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
【新加坡】納米電子器件項目組有“聯(lián)合培養(yǎng)博士生”名額
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
重慶交大材料學(xué)院26年碩士招生復(fù)試實施細則已出。歡迎加入光子學(xué)微結(jié)構(gòu)與器件課題組。
已經(jīng)有0人回復(fù)
★★★★★ 五星級,優(yōu)秀推薦
|
使用廣州天河二號進行castep計算，當(dāng)選用HSE06計算帶隙時出現(xiàn)如下錯誤!（MS版本為7.0） ERROR: Shifted MP set detected/supplied - unshifted MP k-point set required for an NLXC calculation Current trace stack: nlxc_basis_initialise_complex nlxc_basis_initialise nlxc_initialise castep 煩請樓主指導(dǎo)！  |
3樓2016-04-08 19:13:00
2樓2016-03-23 20:41:41
6樓2016-04-30 23:13:12
8樓2016-06-23 18:06:10
9樓2016-07-04 11:57:06
10樓2016-07-04 12:10:06
|
我們公司已在天河二號上架好了gateway,想使用的伙伴們只需在自己的MS中加上Gateway就可以提交作業(yè)計算了。非常方便，不用折騰。有需要嘗試的，我可以申請試算帳號體驗 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
13樓2017-03-13 19:35:39
16樓2017-10-17 18:51:47
19樓2018-02-26 22:06:32
20樓2018-02-27 10:21:26
21樓2018-02-27 10:23:09
23樓2018-05-23 23:23:46
24樓2018-09-29 10:01:58
25樓2018-09-29 11:05:20
26樓2018-10-01 16:34:40
27樓2018-10-30 19:51:50
28樓2018-10-31 10:38:31
30樓2021-01-07 10:23:45
31樓2021-07-09 17:02:18
老師您好，現(xiàn)在資源小木蟲上面無法下載資源了，請問能不能勞煩老師發(fā)一下資源 ，目前我們課題遇到了forceit模塊提交問題。郵箱為565197645@qq.com。謝謝老師了！發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
33樓2021-11-17 13:31:36
簡單回復(fù)
sunpixel4樓
2016-04-09 07:02
回復(fù)
2016-04-09 20:53
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
書蟲呆呆7樓
2016-05-20 14:28
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
xiaozhigang11樓
2017-01-16 10:15
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
saphy12樓
2017-03-13 18:36
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
hdlghzb14樓
2017-03-16 14:42
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
neu2009112015樓
2017-03-20 17:20
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
lisu55517樓
2017-10-31 11:01
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
xiaowandouer18樓
2018-02-06 15:40
回復(fù)
五星好評 感謝分享�。�！
gsdgh22樓
2018-02-27 10:46
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
blue松松29樓
2019-12-08 20:25
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
ChestNuT3T32樓
2021-11-17 13:24
回復(fù)
五星好評 頂一下，感謝分享！
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 kgoing 的主題更新
| 33 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考博] 26申博自薦 +3 | whh869393 2026-03-24 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 材料調(diào)劑 +5 | 匹克i 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 081700 調(diào)劑 267分 +8 | 迷人的哈哈 2026-03-23 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 生物學(xué)學(xué)碩求調(diào)劑 +5 | 小羊睡著了? 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
[考研] 335求調(diào)劑 +4 | yuyu宇 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿重慶大學(xué)085700資源與環(huán)境，總分308求調(diào)劑 +7 | 墨墨漠 2026-03-23 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 336化工調(diào)劑 +4 | 王大坦1 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑，英語六級551，有科研經(jīng)歷 +7 | 生物工程調(diào)劑 2026-03-17 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 070300，一志愿北航320求調(diào)劑 +3 | Jerry0216 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿西安交通大學(xué)材料工程專業(yè) 282分求調(diào)劑 +11 | 楓橋ZL 2026-03-18 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中農(nóng)業(yè)071010，總分320求調(diào)劑 +5 | 困困困困坤坤 2026-03-20 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑院校信息 +6 | CX 330 2026-03-21 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +5 | Zhangbod 2026-03-21 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +4 | 來好運來來來 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 286分人工智能專業(yè)請求調(diào)劑愿意跨考！ +4 | lemonzzn 2026-03-17 | 8/400 |
|
|
|
[基金申請]
學(xué)校已經(jīng)提交到NSFC，還能修改嗎？
 40+4
|
babangida 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研]
 材料與化工 322求調(diào)劑
+4
|
然11 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿西安交通大學(xué) 學(xué)碩 354求調(diào)劑211或者雙一流 +3 | 我想要讀研究生 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | eation27 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考博] 申博26年 +3 | 八6八68 2026-03-19 | 3/150 |
|