 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 10030 | 回復(fù): 32 | |||
| 【獎(jiǎng)勵(lì)】 本帖被評(píng)價(jià)17次，作者kgoing增加金幣 12.8 個(gè) | |||
| 當(dāng)前只顯示滿(mǎn)足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
[資源]
如何在天河二號(hào)上安裝Material Studio軟件
|
|||
|
做過(guò)模擬計(jì)算的同仁，應(yīng)該對(duì)于Material Studio軟件比較熟悉，尤其是該軟件友好的界面，是優(yōu)秀的前處理以及后處理軟件之一。但該軟件常用的模塊Castep/Dmol/Forcite的并行效率并不高，即使對(duì)于linux版（更不用說(shuō)Windows版），我想諸君都很少用到百核以上。因此，今天跟大家分享一下如何利用超算（目前運(yùn)行最快的天河二號(hào)為例）的分布式系統(tǒng)，突破并行核數(shù)以及內(nèi)存的限制。 如果大家有該軟件版權(quán)的話，不妨根據(jù)附件的安裝文檔，自己嘗試安裝。MS常用的版本包括60/70/80，安裝以及使用的方法則是大同小異，我已經(jīng)將安裝文檔、腳本（針對(duì)天河二號(hào)的SLUERM系統(tǒng)）以及相關(guān)的文件（支持高速網(wǎng)的庫(kù)文件）添加到附件中，大家可以結(jié)合安裝文檔的內(nèi)容去使用其他附件。同時(shí)建議大家安裝成功以后一定要進(jìn)行正確性測(cè)試，用自己熟悉的算例結(jié)果去比對(duì)。 在此，需要分享的一個(gè)經(jīng)驗(yàn)的是，雖然天河二號(hào)的收費(fèi)方式是以一個(gè)結(jié)點(diǎn)為計(jì)算單元（一個(gè)結(jié)點(diǎn)24核，即用1核和用24個(gè)核是一樣的收費(fèi)方式），但并不一定每個(gè)算例用滿(mǎn)一個(gè)結(jié)點(diǎn)CPU物理核的性能最好（舉個(gè)例子：任務(wù)量一定，過(guò)多CPU物理核的參與，會(huì)把時(shí)間浪費(fèi)在協(xié)調(diào)上），如果不太清楚自己算例的情況，可以做擴(kuò)展性測(cè)試，從1、2、4、8、16...核數(shù)一直往上測(cè)執(zhí)行時(shí)間，在時(shí)間曲線的拐點(diǎn)附近尋找最優(yōu)核數(shù)。 PS：有問(wèn)題的蟲(chóng)友，請(qǐng)給我留言，如果相關(guān)內(nèi)容有問(wèn)題，我會(huì)及時(shí)更新。。 |
回復(fù)此樓» 本帖附件資源列表
-
歡迎監(jiān)督和反饋：小木蟲(chóng)僅提供交流平臺(tái)，不對(duì)該內(nèi)容負(fù)責(zé)。
本內(nèi)容由用戶(hù)自主發(fā)布，如果其內(nèi)容涉及到知識(shí)產(chǎn)權(quán)問(wèn)題，其責(zé)任在于用戶(hù)本人，如對(duì)版權(quán)有異議，請(qǐng)聯(lián)系郵箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : MS_lib.tar.gz
- 附件 2 : 如何在天河二號(hào)上安裝MS.pdf
- 附件 3 : sub_script.tar.gz
2016-03-17 17:48:13, 28.33 M
2016-03-17 17:48:21, 404.59 K
2016-03-21 15:06:26, 713 bytes
» 收錄本帖的淘帖專(zhuān)輯推薦
 NWCHEM |
» 猜你喜歡
請(qǐng)問(wèn)還有沒(méi)有用Latex寫(xiě)文章的小伙伴們？
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
光學(xué)工程學(xué)碩調(diào)劑信息
已經(jīng)有32人回復(fù)
-
物理學(xué)I論文潤(rùn)色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有79人回復(fù)
-
歡迎加入課題組
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
散金幣，求好運(yùn)，祝面上順利！
已經(jīng)有78人回復(fù)
-
華東師范大學(xué)芯片設(shè)計(jì)徐瓏真實(shí)水平咋樣
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
調(diào)劑
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
【新加坡】納米電子器件項(xiàng)目組有“聯(lián)合培養(yǎng)博士生”名額
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
中德博士后2026項(xiàng)目5月30日截止- 國(guó)內(nèi)博士后入站、德國(guó)兩年全職
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
面向全球申請(qǐng)人的中德博士后2026項(xiàng)目5月30日截止- 國(guó)內(nèi)博后入站德國(guó)兩年全職
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
【新加坡】納米電子器件項(xiàng)目組有“聯(lián)合培養(yǎng)博士生”名額
已經(jīng)有2人回復(fù)
30樓2021-01-07 10:23:45
vasp001
金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 69 (初中生)
- 金幣: 1513.7
- 帖子: 702
- 在線: 326小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 727265
2樓2016-03-23 20:41:41
典韋123
鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 39 (小學(xué)生)
- 金幣: 8551.7
- 帖子: 811
- 在線: 356.9小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1733444
★★★★★ 五星級(jí),優(yōu)秀推薦
|
使用廣州天河二號(hào)進(jìn)行castep計(jì)算，當(dāng)選用HSE06計(jì)算帶隙時(shí)出現(xiàn)如下錯(cuò)誤!（MS版本為7.0） ERROR: Shifted MP set detected/supplied - unshifted MP k-point set required for an NLXC calculation Current trace stack: nlxc_basis_initialise_complex nlxc_basis_initialise nlxc_initialise castep 煩請(qǐng)樓主指導(dǎo)！  |
3樓2016-04-08 19:13:00
vasp001
金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 69 (初中生)
- 金幣: 1513.7
- 帖子: 702
- 在線: 326小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 727265
6樓2016-04-30 23:13:12
簡(jiǎn)單回復(fù)
sunpixel4樓
2016-04-09 07:02
回復(fù)
2016-04-09 20:53
回復(fù)
五星好評(píng) 頂一下，感謝分享！
2016-05-20 14:28
回復(fù)
五星好評(píng) 頂一下，感謝分享！
xiaozhigang11樓
2017-01-16 10:15
回復(fù)
五星好評(píng) 頂一下，感謝分享！
saphy12樓
2017-03-13 18:36
回復(fù)
五星好評(píng) 頂一下，感謝分享！
hdlghzb14樓
2017-03-16 14:42
回復(fù)
五星好評(píng) 頂一下，感謝分享！
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 284求調(diào)劑 +10 | Zhao anqi 2026-03-22 | 10/500 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 07化學(xué)280分求調(diào)劑 +4 | 722865 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +7 | 十三加油 2026-03-21 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料調(diào)劑 +3 | 匹克i 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 327求調(diào)劑 +5 | prayer13 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 384求調(diào)劑 +3 | 子系博 2026-03-22 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑 +4 | LHHL66 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +3 | 余意卿 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研]
 一志愿東華大學(xué)化學(xué)070300，求調(diào)劑
+7
|
2117205181 2026-03-21 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 13341 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求助 +5 | 夢(mèng)里的無(wú)言 2026-03-21 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 265求調(diào)劑 +12 | 梁梁校校 2026-03-19 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 22 350 本科985求調(diào)劑，求老登收留 +3 | 李軼男003 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +9 | 想上學(xué)吖吖 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研]
295復(fù)試調(diào)劑
+8
|
簡(jiǎn)木ChuFront 2026-03-19 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿西安交通大學(xué) 學(xué)碩 354求調(diào)劑211或者雙一流 +3 | 我想要讀研究生 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉林大學(xué)材料學(xué)碩321求調(diào)劑 +11 | Ymlll 2026-03-18 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +5 | pupcoco 2026-03-17 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +3 | 妮妮ninicgb 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 考研求調(diào)劑 +3 | 橘頌. 2026-03-17 | 4/200 |
|