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[資源]
如何在天河二號上安裝Material Studio軟件
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做過模擬計算的同仁，應該對于Material Studio軟件比較熟悉，尤其是該軟件友好的界面，是優(yōu)秀的前處理以及后處理軟件之一。但該軟件常用的模塊Castep/Dmol/Forcite的并行效率并不高，即使對于linux版（更不用說Windows版），我想諸君都很少用到百核以上。因此，今天跟大家分享一下如何利用超算（目前運行最快的天河二號為例）的分布式系統(tǒng)，突破并行核數(shù)以及內存的限制。 如果大家有該軟件版權的話，不妨根據(jù)附件的安裝文檔，自己嘗試安裝。MS常用的版本包括60/70/80，安裝以及使用的方法則是大同小異，我已經(jīng)將安裝文檔、腳本（針對天河二號的SLUERM系統(tǒng)）以及相關的文件（支持高速網(wǎng)的庫文件）添加到附件中，大家可以結合安裝文檔的內容去使用其他附件。同時建議大家安裝成功以后一定要進行正確性測試，用自己熟悉的算例結果去比對。 在此，需要分享的一個經(jīng)驗的是，雖然天河二號的收費方式是以一個結點為計算單元（一個結點24核，即用1核和用24個核是一樣的收費方式），但并不一定每個算例用滿一個結點CPU物理核的性能最好（舉個例子：任務量一定，過多CPU物理核的參與，會把時間浪費在協(xié)調上），如果不太清楚自己算例的情況，可以做擴展性測試，從1、2、4、8、16...核數(shù)一直往上測執(zhí)行時間，在時間曲線的拐點附近尋找最優(yōu)核數(shù)。 PS：有問題的蟲友，請給我留言，如果相關內容有問題，我會及時更新。。 |
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- 附件 2 : 如何在天河二號上安裝MS.pdf
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2016-03-17 17:48:13, 28.33 M
2016-03-17 17:48:21, 404.59 K
2016-03-21 15:06:26, 713 bytes
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8樓2016-06-23 18:06:10
9樓2016-07-04 11:57:06
10樓2016-07-04 12:10:06
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我們公司已在天河二號上架好了gateway,想使用的伙伴們只需在自己的MS中加上Gateway就可以提交作業(yè)計算了。非常方便，不用折騰。有需要嘗試的，我可以申請試算帳號體驗 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
13樓2017-03-13 19:35:39
16樓2017-10-17 18:51:47
19樓2018-02-26 22:06:32
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30樓2021-01-07 10:23:45
31樓2021-07-09 17:02:18
老師您好，現(xiàn)在資源小木蟲上面無法下載資源了，請問能不能勞煩老師發(fā)一下資源 ，目前我們課題遇到了forceit模塊提交問題。郵箱為565197645@qq.com。謝謝老師了！發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
33樓2021-11-17 13:31:36
簡單回復
sunpixel4樓
2016-04-09 07:02
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2016-04-09 20:53
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書蟲呆呆7樓
2016-05-20 14:28
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