 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2626 | 回復: 13 | |||
| 當前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
mymarik鐵桿木蟲 (小有名氣)
|
[求助]
安裝lammps的時候 出現(xiàn)fftw3d相關的一些提示 能幫我看看是什么問題嗎 已有2人參與
|
||
|
我在想是不是 要去除某個 package fft3d.o：在函數(shù)‘fft_3d’中： /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:151：對‘fftwf_execute_dft’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:214：對‘fftwf_execute_dft’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:277：對‘fftwf_execute_dft’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:151：對‘fftwf_execute_dft’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:214：對‘fftwf_execute_dft’未定義的引用 fft3d.o:/home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:277: 跟著更多未定義的參考到 fftwf_execute_dft fft3d.o：在函數(shù)‘fft_3d_create_plan’中： /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:852：對‘fftwf_plan_many_dft’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:857：對‘fftwf_plan_many_dft’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:862：對‘fftwf_plan_many_dft’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:867：對‘fftwf_plan_many_dft’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:872：對‘fftwf_plan_many_dft’未定義的引用 fft3d.o:/home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:877: 跟著更多未定義的參考到 fftwf_plan_many_dft fft3d.o：在函數(shù)‘fft_3d_destroy_plan’中： /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:987：對‘fftwf_destroy_plan’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:988：對‘fftwf_destroy_plan’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:989：對‘fftwf_destroy_plan’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:990：對‘fftwf_destroy_plan’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:991：對‘fftwf_destroy_plan’未定義的引用 fft3d.o:/home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:992: 跟著更多未定義的參考到 fftwf_destroy_plan fft3d.o：在函數(shù)‘fft_1d_only’中： /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:1218：對‘fftwf_execute_dft’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:1223：對‘fftwf_execute_dft’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:1228：對‘fftwf_execute_dft’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:1218：對‘fftwf_execute_dft’未定義的引用 /home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:1223：對‘fftwf_execute_dft’未定義的引用 fft3d.o:/home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi/../fft3d.cpp:1228: 跟著更多未定義的參考到 fftwf_execute_dft collect2: error: ld returned 1 exit status Makefile:91: recipe for target '../lmp_mpi' failed make[1]: *** [../lmp_mpi] Error 1 make[1]: Leaving directory '/home/tree/Software/lammps/src/Obj_mpi' Makefile:129: recipe for target 'mpi' failed make: *** [mpi] Error 2 |
回復此樓» 猜你喜歡
化學求調劑
已經(jīng)有5人回復
-
一志愿中國石油大學（華東） 本科齊魯工業(yè)大學
已經(jīng)有3人回復
-
332求調劑
已經(jīng)有4人回復
-
265求調劑
已經(jīng)有9人回復
-
328求調劑，英語六級551，有科研經(jīng)歷
已經(jīng)有8人回復
-
求調劑
已經(jīng)有3人回復
-
278求調劑
已經(jīng)有6人回復
-
307求調劑
已經(jīng)有10人回復
-
279分求調劑 一志愿211
已經(jīng)有12人回復
-
297求調劑
已經(jīng)有9人回復
» 本主題相關價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- ubuntu14.04 下安裝lammps時mpich.3.2的問題
已經(jīng)有0人回復
- 安裝lammps時，沒有makefile.g++文件該怎么做？
已經(jīng)有6人回復
- win7 64位下安裝lammps ，MPI注冊時顯示Unable to run "mpiexec -register"
已經(jīng)有2人回復
- Win7 64位下安裝Lammps和MPICH實現(xiàn)單機并行計算20150602（原創(chuàng)）
已經(jīng)有168人回復
- 在安裝LAMMPS出現(xiàn)的一個奇怪的問題，各位大神路過看看。
已經(jīng)有10人回復
- lammps 新版本運行in文件出現(xiàn)ERROR: Invalid fix style
已經(jīng)有9人回復
- Ubuntu下安裝lammps單機版（no MPI，no FFT）幾點心得
已經(jīng)有5人回復
- Lammps安裝時，其中的reax和meam包的安裝問題
已經(jīng)有2人回復
- 哪位老師肯幫助我看下，安裝lammps到最后時出現(xiàn)什么問題
已經(jīng)有3人回復
- 請教大神如何在64bit的win7系統(tǒng)下正確安裝Lammps？計算機是4核的處理器
已經(jīng)有14人回復
- lammps安裝時mpich2的問題
已經(jīng)有2人回復
- lammps中的user-ewaldn package
已經(jīng)有0人回復
- mpich 和lammps并行
已經(jīng)有2人回復
- 我在Ubuntu下運行Lammps時遇到的問題 希望得到幫助
已經(jīng)有2人回復
- lammps安裝求助
已經(jīng)有2人回復
- 安裝lammps并行編譯時 出現(xiàn)的問題
已經(jīng)有5人回復
- 求大家?guī)椭陆鉀Qlammps安裝問題
已經(jīng)有2人回復
- win server 2003下lammps的并行安裝問題
已經(jīng)有0人回復
- lammps 并行安裝時,mpich怎么就是裝不上去呢？
已經(jīng)有0人回復
- lammps中ewald/n的使用
已經(jīng)有3人回復
- 【求助】遇到LAMMPS安裝問題，敬請高手相助
已經(jīng)有6人回復
- 【討論】編譯lammps時Makefile的修改問題
已經(jīng)有8人回復
alundilong
木蟲 (正式寫手)
- 應助: 129 (高中生)
- 金幣: 2019.1
- 紅花: 18
- 帖子: 309
- 在線: 56小時
- 蟲號: 595468
- 注冊: 2008-09-08
- 性別: GG
- 專業(yè): 傳熱傳質學
【答案】應助回帖
|
FFT_INC = -DFFT_FFTW3 -DFFT_SINGLE -I/home/tree/Software/fftw/kernel FFT_PATH = -L/usr/local/lib FFT_LIB = -lfftw3 看到這里，我有如下推測，不知準不準確：樓主的fftw是自己進行編譯，并且設置configure的時候 使用了./configure --prefix=/home/tree/Software/fftw。如果我的想法是成立的話，我建議樓主將FFT_PATH改成FFT_PATH=-L/home/tree/Software/fftw/lib, 將FFT_INC改成 FFT_INC = -DFFT_FFTW3 -DFFT_SINGLE -I/home/tree/Software/fftw/include 其他不變。 如果以上推測成立，即樓主自行編譯安裝了mpich，并且使用了--prefix=/home/tree/Software/mpich/ 建議樓主做相應修改，即MPI_INC = -DMPICH_SKIP_MPICXX -I/home/tree/Software/mpich/include 和MPI_PATH = -L/home/tree/Software/mpich/lib MPI_INC = -DMPICH_SKIP_MPICXX -I/home/tree/Software/mpich/src/include MPI_PATH = -L/usr/local/lib MPI_LIB = -lmpich -lmpl -lpthread 對于JPG，建議也做如上相應的修改。 JPG_INC = -I/home/tree/Software/jpeg JPG_PATH = -L/usr/local/lib JPG_LIB = /usr/local/lib/libjpeg.a |
4樓2016-04-01 01:31:26
alundilong
木蟲 (正式寫手)
- 應助: 129 (高中生)
- 金幣: 2019.1
- 紅花: 18
- 帖子: 309
- 在線: 56小時
- 蟲號: 595468
- 注冊: 2008-09-08
- 性別: GG
- 專業(yè): 傳熱傳質學
2樓2016-03-31 21:31:18
mymarik
鐵桿木蟲 (小有名氣)
- 應助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 6141.8
- 紅花: 10
- 帖子: 230
- 在線: 62.3小時
- 蟲號: 1941520
- 注冊: 2012-08-16
- 專業(yè): 機械結構強度學
|
如果不安裝多余的package（即用系統(tǒng)默認的package） 可以成功編譯 而且能跑一部分例子 # mpi = default MPI compiler, default MPI SHELL = /bin/sh # --------------------------------------------------------------------- # compiler/linker settings # specify flags and libraries needed for your compiler CC = g++ #mpicxx CCFLAGS = -g -O3 -DLAMMPS_MEMALIGN=64 SHFLAGS = -fPIC DEPFLAGS = -M LINK = g++ #mpicxx LINKFLAGS = -g -O LIB = SIZE = size ARCHIVE = ar ARFLAGS = -rc SHLIBFLAGS = -shared # --------------------------------------------------------------------- # LAMMPS-specific settings, all OPTIONAL # specify settings for LAMMPS features you will use # if you change any -D setting, do full re-compile after "make clean" # LAMMPS ifdef settings # see possible settings in Section 2.2 (step 4) of manual LMP_INC = -DLAMMPS_GZIP # MPI library # see discussion in Section 2.2 (step 5) of manual # MPI wrapper compiler/linker can provide this info # can point to dummy MPI library in src/STUBS as in Makefile.serial # use -D MPICH and OMPI settings in INC to avoid C++ lib conflicts # INC = path for mpi.h, MPI compiler settings # PATH = path for MPI library # LIB = name of MPI library MPI_INC = -DMPICH_SKIP_MPICXX -I/home/tree/Software/mpich/src/include MPI_PATH = -L/usr/local/lib MPI_LIB = -lmpich -lmpl -lpthread # FFT library # see discussion in Section 2.2 (step 6) of manual # can be left blank to use provided KISS FFT library # INC = -DFFT setting, e.g. -DFFT_FFTW, FFT compiler settings # PATH = path for FFT library # LIB = name of FFT library FFT_INC = -DFFT_FFTW3 -DFFT_SINGLE -I/home/tree/Software/fftw/kernel FFT_PATH = -L/usr/local/lib FFT_LIB = -lfftw3 # JPEG and/or PNG library # see discussion in Section 2.2 (step 7) of manual # only needed if -DLAMMPS_JPEG or -DLAMMPS_PNG listed with LMP_INC # INC = path(s) for jpeglib.h and/or png.h # PATH = path(s) for JPEG library and/or PNG library # LIB = name(s) of JPEG library and/or PNG library JPG_INC = -I/home/tree/Software/jpeg JPG_PATH = -L/usr/local/lib JPG_LIB = /usr/local/lib/libjpeg.a # --------------------------------------------------------------------- # build rules and dependencies # do not edit this section include Makefile.package.settings include Makefile.package EXTRA_INC = $(LMP_INC) $(PKG_INC) $(MPI_INC) $(FFT_INC) $(JPG_INC) $(PKG_SYSINC) EXTRA_PATH = $(PKG_PATH) $(MPI_PATH) $(FFT_PATH) $(JPG_PATH) $(PKG_SYSPATH) EXTRA_LIB = $(PKG_LIB) $(MPI_LIB) $(FFT_LIB) $(JPG_LIB) $(PKG_SYSLIB) EXTRA_CPP_DEPENDS = $(PKG_CPP_DEPENDS) EXTRA_LINK_DEPENDS = $(PKG_LINK_DEPENDS) # Path to src files vpath %.cpp .. vpath %.h .. # Link target $(EXE): $(OBJ) $(EXTRA_LINK_DEPENDS) $(LINK) $(LINKFLAGS) $(EXTRA_PATH) $(OBJ) $(EXTRA_LIB) $(LIB) -o $(EXE) $(SIZE) $(EXE) # Library targets lib: $(OBJ) $(EXTRA_LINK_DEPENDS) $(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(EXE) $(OBJ) shlib: $(OBJ) $(EXTRA_LINK_DEPENDS) $(CC) $(CCFLAGS) $(SHFLAGS) $(SHLIBFLAGS) $(EXTRA_PATH) -o $(EXE) \ $(OBJ) $(EXTRA_LIB) $(LIB) # Compilation rules %.o:%.cpp $(EXTRA_CPP_DEPENDS) $(CC) $(CCFLAGS) $(SHFLAGS) $(EXTRA_INC) -c $< %.d:%.cpp $(EXTRA_CPP_DEPENDS) $(CC) $(CCFLAGS) $(EXTRA_INC) $(DEPFLAGS) $< > $@ %.o:%.cu $(EXTRA_CPP_DEPENDS) $(CC) $(CCFLAGS) $(SHFLAGS) $(EXTRA_INC) -c $< # Individual dependencies DEPENDS = $(OBJ:.o=.d) sinclude $(DEPENDS) |
3樓2016-03-31 21:41:35
mymarik
鐵桿木蟲 (小有名氣)
- 應助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 6141.8
- 紅花: 10
- 帖子: 230
- 在線: 62.3小時
- 蟲號: 1941520
- 注冊: 2012-08-16
- 專業(yè): 機械結構強度學
|
我安裝的時候沒有指定地址 直接是 ./configure 我是搜索了相應文件所在的目錄設定的那些路徑 我的fftw 文件夾里沒有l(wèi)ib 相關的文件也被安裝在了系統(tǒng)的lib里面 你說的這個問題 如果我路徑設置錯誤 那應該沒有辦法編譯出可計算的程序吧 可是 我在這之前 沒有添加其他package的時候就成功編譯出來可以跑的程序 所以 我覺得是不是某個package里對fftw3d有要求 如果我去掉這個包 應該就不會有這個提示吧 我是這樣想的 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
5樓2016-04-01 11:22:04
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 化學求調劑 +4 | 臨澤境llllll 2026-03-17 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 求調劑 +3 | Ma_xt 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 297求調劑 +9 | 戲精丹丹丹 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中科技大學，080502，354分求調劑 +5 | 守候夕陽CF 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學 ，070300化學學碩，總分287，雙非一本，求調劑。 +3 | 晨昏線與星海 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 南京大學化學376求調劑 +3 | hisfailed 2026-03-19 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿南昌大學，327分，材料與化工085600 +9 | Ncdx123456 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 304求調劑 +7 | 司空. 2026-03-18 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 323求調劑 +3 | 洼小桶 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 329求調劑 +9 | 想上學吖吖 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中農(nóng)業(yè)071010，總分320求調劑 +3 | 困困困困坤坤 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學調劑 ，六級已過，有科研經(jīng)歷 +13 | 曦熙兮 2026-03-15 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 求調劑 +3 | @taotao 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0856調劑，是學校就去 +8 | sllhht 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 一志愿西安交通大學材料工程專業(yè) 282分求調劑 +5 | 楓橋ZL 2026-03-18 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 286求調劑 +6 | lemonzzn 2026-03-16 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 材料專碩306英一數(shù)二 +10 | z1z2z3879 2026-03-16 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 收復試調劑生 +4 | 雨后秋荷 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿211 0703方向310分求調劑 +3 | 努力奮斗112 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 327求調劑 +6 | 拾光任染 2026-03-15 | 11/550 |
|