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cf_success金蟲 (小有名氣)
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[求助]
高斯計(jì)算單點(diǎn)能之前一定要優(yōu)化嗎? 已有1人參與
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RT,通過單晶衍射再用shlex等晶體學(xué)軟件精修好,得到cif晶體學(xué)數(shù)據(jù)文件,再導(dǎo)出xyz坐標(biāo)文件,導(dǎo)入gaussian view做成gjf文件,然后用gaussian09計(jì)算。 這樣在計(jì)算前也需要先優(yōu)化再計(jì)算嗎?優(yōu)化之后是不是會改變一些鍵長鍵角數(shù)據(jù)? @jiewei 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
金蟲 (小有名氣)
版主 (著名寫手)
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取出的部分它在晶體中還受周圍原子的影響,二者在鍵長、鍵角上都會有改變。 如果是研究取出部分的性能,要進(jìn)行優(yōu)化。如果取出部分與周圍有斷鍵,則要“封頭”,不使存在自由基。 如果取出部分是雙分子,要看它們之間的氫鍵、范德華作用,如從晶體中取出的葉綠素二聚體,則不必優(yōu)化,反而能更接近晶體中的氫鍵、范德華作用。 |
木蟲 (小有名氣)
新蟲 (初入文壇)
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