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1257851289新蟲 (小有名氣)
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[求助]
PCR沒(méi)有目的條帶,引物二聚體很明顯 已有1人參與
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程序是95℃5min 95℃30s 60℃30s 72℃5min 32個(gè)循環(huán) 72℃延伸7min,目的條帶4200bp,第一次很亮,后來(lái)帶就不明顯了,送原液測(cè)序不行,現(xiàn)在帶都沒(méi)了。求助該怎么改進(jìn) 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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您好!PCR的問(wèn)題向來(lái)號(hào)稱最簡(jiǎn)單也最復(fù)雜。您這種情況,從您“第一次很亮”的描述來(lái)看,引物是匹配的,條件是可以的,后面重復(fù)實(shí)驗(yàn)擴(kuò)不出來(lái),則有可能是引物降解、模板降解、酶活失效等原因。個(gè)人認(rèn)為模板降解的可能性最大。 但是如果“第一次很亮”是一種贗像,那您就需要仔細(xì)排查引物的設(shè)計(jì),擴(kuò)增條件的設(shè)定,模板的質(zhì)量等所有體系因素了。通常的,換引物比較常見(jiàn);擴(kuò)增不出來(lái)時(shí),降低退火溫度到50℃也是可以嘗試的;當(dāng)然,模板的質(zhì)量還是要討論的,可以跑下膠,測(cè)下濃度什么的。通常酶失活的情況少見(jiàn),但有條件的話,找一管陽(yáng)性的酶試試,說(shuō)不定有幫助呢。 總之,要設(shè)計(jì)對(duì)比實(shí)驗(yàn)對(duì)各種因素排查,有問(wèn)題可以再交流。祝好運(yùn)! |

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