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烏托小邦木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
小蟲(chóng)蟲(chóng)
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[求助]
關(guān)于Cas9-sgRNA構(gòu)建的困惑,質(zhì)粒一直提不出來(lái),向大家求助。
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最近在試著做Cas9,想敲掉一個(gè)基因,選擇了六個(gè)靶點(diǎn)。其中四個(gè)sgRNA很順利就連進(jìn)Cas9載體了,但是有兩個(gè)靶點(diǎn)的sgRNA死活弄不出來(lái),退火-連接-轉(zhuǎn)化-挑斑-菌液PCR都沒(méi)有問(wèn)題(菌液PCR100%正確),然后我就抽提質(zhì)粒送去測(cè)序。 1)測(cè)序公司告訴我質(zhì)粒電泳沒(méi)有條帶,一片模糊; 2)我就自己也跑了電泳,確實(shí)永遠(yuǎn)都是一片模糊的; 3)然后我就懷疑是不是質(zhì)粒抽提試劑盒壞了,我就直接拿菌液送去測(cè)序,測(cè)序公司(兩家)也說(shuō)抽提不出來(lái)質(zhì)粒; 4)但是我拿菌液劃線,是能正常長(zhǎng)斑的; 5)抽提的質(zhì)粒重新轉(zhuǎn)化卻啥也沒(méi)長(zhǎng); 6)換了一家合成引物的公司,重新合成引物,結(jié)果依舊; 7)已經(jīng)做了三次了,抽提試劑盒也換了新的,都是這樣的,問(wèn)題到底出在哪里呢?有這方面經(jīng)驗(yàn)的大神能指點(diǎn)一下不? 我用的這個(gè)載體是14kb,是因?yàn)檩d體太大嗎?如果是這個(gè)原因的話,為什么另外四個(gè)很順利成功呢? 關(guān)于Cas9技術(shù),我今年剛接觸,不是太懂,異想天開(kāi)一下:會(huì)不會(huì)是這兩個(gè)靶點(diǎn)跟component cell里的某個(gè)基因匹配,cas9在component cell里發(fā)生切割作用了?(我也不知道這個(gè)時(shí)候Cas9是否能發(fā)揮作用,實(shí)在是想不出問(wèn)題在哪,瞎猜的。。) 求幫助,求指點(diǎn)! |

金蟲(chóng) (小有名氣)
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小蟲(chóng)蟲(chóng)

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