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烏托小邦木蟲 (正式寫手)
小蟲蟲
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[求助]
關(guān)于Cas9-sgRNA構(gòu)建的困惑,質(zhì)粒一直提不出來,向大家求助!
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最近在試著做Cas9,想敲掉一個基因,選擇了六個靶點。其中四個sgRNA很順利就連進Cas9載體了,但是有兩個靶點的sgRNA死活弄不出來,退火-連接-轉(zhuǎn)化-挑斑-菌液PCR都沒有問題(菌液PCR100%正確),然后我就抽提質(zhì)粒送去測序。 1)測序公司告訴我質(zhì)粒電泳沒有條帶,一片模糊; 2)我就自己也跑了電泳,確實永遠都是一片模糊的; 3)然后我就懷疑是不是質(zhì)粒抽提試劑盒壞了,我就直接拿菌液送去測序,測序公司(兩家)也說抽提不出來質(zhì)粒; 4)但是我拿菌液劃線,是能正常長斑的; 5)抽提的質(zhì)粒重新轉(zhuǎn)化卻啥也沒長; 6)換了一家合成引物的公司,重新合成引物,結(jié)果依舊; 7)已經(jīng)做了三次了,抽提試劑盒也換了新的,都是這樣的,問題到底出在哪里呢?有這方面經(jīng)驗的大神能指點一下不? 我用的這個載體是14kb,是因為載體太大嗎?如果是這個原因的話,為什么另外四個很順利成功呢? 關(guān)于Cas9技術(shù),我今年剛接觸,不是太懂,異想天開一下:會不會是這兩個靶點跟component cell里的某個基因匹配,cas9在component cell里發(fā)生切割作用了?(我也不知道這個時候Cas9是否能發(fā)揮作用,實在是想不出問題在哪,瞎猜的。。) 求幫助,求指點! |

金蟲 (小有名氣)
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說一下你的異想天開真的是異想天開了,首先:cas9是蛋白,你構(gòu)建的質(zhì)粒,這時cas9還不會表達呢;其次你連得靶點是不帶pam序列的,cas9切割就是靠著你的靶點與基因組含pam序列的位點匹配后發(fā)生切割作用的。我也在做,不過我們的靶點和cas是分開合的。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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