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zhangdie新蟲 (初入文壇)
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[求助]
請問驗證cds全長序列設(shè)計引物(cDNA模板),后二十堿基幾乎沒有GC怎么辦
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為了設(shè)計這個引物我查了好多資料,pp5也下了學了但是驗證cds的引物基本上只有前二十和后二十這種設(shè)計法,但我下游引物用了最后二十四個堿基CG含量才大概20%,退火溫度五十都不到,跑出條帶做了連接轉(zhuǎn)化但結(jié)果都不是目的基因。有人說用utr區(qū)設(shè)計,但是我5‘utr只有十五個已知堿基,是需要先做個5race嗎?或者前輩們有什么別的方法?求指點謝謝 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
新蟲 (小有名氣)
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提取完RNA后逆轉(zhuǎn)錄時用特異性引物ATATATAT…(你不是說下游是二十來個AT重復(fù)嗎?)這樣可以大大提高后面PCR擴增幾率~ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
至尊木蟲 (著名寫手)
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能擴出來應(yīng)該可以用吧,要不然你把這個擴出來的前段連個T載,再測序看看是不是目的前段 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |

新蟲 (初入文壇)
至尊木蟲 (著名寫手)

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