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電轉(zhuǎn)化注意事項
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一、 制備感受態(tài)的菌液收集時間: 1、準確測定OD值:OD在1.2~1.5之間。 1) 為了準確測定OD值,建議將菌液稀釋不同濃度測定(1、2、4、8、16倍稀釋,看其OD值是否呈線性關(guān)系)。每個倍數(shù)做3-5個重復,應該可以大致推斷OD值是否準確!菌液看上去渾濁,但OD值不高,很可能OD稀釋倍數(shù)不夠! 2) OD值是否測準也可以這樣估算:OD600為40左右時,菌體濕重(6000rpm離心5min)約0.95g/10ml。高密度發(fā)酵時菌體濕重將相應下降。 2、75ml的菌,經(jīng)18h左右的培養(yǎng),最后sorbital洗滌完畢后,50ml離心管里所剩菌體特別濃,需要1ml sorbitol才可溶解為糊狀。正常培養(yǎng)的OD在1.2~1.5之間的500ml菌液,收集的感受態(tài)也用1ml稀釋的,沒那么粘稠?梢钥纯唇档团囵B(yǎng)溫度(27攝氏度)或縮短培養(yǎng)時間(12h)。 3、甚至不用轉(zhuǎn)接,直接挑單克隆在50-100mlYPD中搖過夜,效果也很好 二、制備感受態(tài)的菌液量 如果只轉(zhuǎn)一個樣品,50ml就夠了,一般50ml的培養(yǎng)液如果OD值正常的話夠做10管感受態(tài)的,其他的按比例縮小。用大試管搖5ml菌液,然后取1ml毫升在1.5mlEP管中制感受態(tài),每一步的離心時間30秒就行。整個流程時間短,制備好的感受態(tài)用來做轉(zhuǎn)化的效率很高。 山梨醇離心,洗滌的過程之后的重懸的時候注意濃度,不要過于粘稠和稀釋。 三、感受態(tài)的保存 感受態(tài)細胞做好后由于電轉(zhuǎn)化杯還沒有處理好等原因,在冰上放幾個小時再做可能有一定的影響,盡量馬上制備馬上轉(zhuǎn)化。如果感受態(tài)細胞要保存,不需要加甘油,一般80ul EP管分裝,-70 或 -80 攝氏度保存。 另附:酵母GS115點種分離純化 接種GS115于5ml YPD液體培養(yǎng)基,30℃,200rpm振蕩過夜,涂布 YPD平板,30℃培養(yǎng)48 小時,用 YNB基本培養(yǎng)基和含His的補充培養(yǎng)基作點種分離純化,挑選在補充培養(yǎng)基生上生長而在基本培養(yǎng)基上不生長的單菌落劃YPD平板,4℃保存。 四、電轉(zhuǎn)化注意點: 1、感受態(tài)做好后,最后一次吸出sorbital時,不是直接倒調(diào)的,而是用毛細管輕吸出來的,這樣可能使剩下的感受態(tài)純凈些。 2、最后用毛細管取出100ul出來,加入質(zhì)粒,混勻。ㄅ铝坎粔,吸得很多,電轉(zhuǎn)時效果反而不好。 ) 3、電轉(zhuǎn)杯清潔處理:一般先沖洗,洗凈;然后浸泡在75%的乙醇中;使用前我們都是放在超凈臺上,開啟紫外,邊吹風晾干,邊進行紫外照射。電轉(zhuǎn)杯的新包裝或重復使用可能對轉(zhuǎn)化率有一定的影響。 4、電擊的時候,電壓數(shù)以及電擊時間可以摸索一下,適當增加電壓或者延長電擊時間都可以。電擊條件比如1.5kv,放電4.8~5.5ms。電擊所有過程都要盡量在冰上進行,電擊時間可以減少一點,設(shè)置為5ms左右,電擊之后馬上加入預冷的山梨醇溶液,轉(zhuǎn)移至EP管,30度靜止培養(yǎng)1h。如果菌體懸液濃度比較大的時候,在制備感受態(tài)的時候要留心一下操作中的問題了。 5、電擊之后,加入1ml的山梨醇,吸入1.5ml的ep管中,置于30度搖床低速培養(yǎng)1h,再涂板。 6、注意的是處理液中的DTT是在使用前加入,其它配好后于4度保存,DTT單獨于-20度保存,可配成100倍的貯備液。 7、轉(zhuǎn)化后1ml用sorbitol重懸的細胞懸液不能全部涂在一塊板子上,按標準程序制作的感受態(tài)一般3塊左右可能比較合適,以干燥后看見一薄層淡淡的白色為宜。轉(zhuǎn)化子會在白色的薄層上長出圓韻、飽滿的大菌落的。 五、轉(zhuǎn)化試劑和培養(yǎng)基的正確準備方法 1、MD板子提前幾天做好,放在冰箱里,涂板的時候吸收效果會好些。如果是新板子,可能吸收不是太好,板子上有些積層,反而不利于生長。 2、YNB42度水浴一會,然后過濾除菌,YNB是加到培養(yǎng)基里面的,去離子水pH偏低,建議直接用蒸餾水就可以(關(guān)系不是太大)。 3、山梨醇,以及無菌去離子水均是冰凍,存放在4度冰箱中 4、一般用10ug以上質(zhì)粒用SalI酶切,然后直接加乙醇沉淀,70%乙醇洗一遍,約20ul ddH2O重溶。轉(zhuǎn)化效率一般大于100個克隆每ugDNA。有人用LiCl和DTT處理細胞,轉(zhuǎn)化效率很高,可以試試。建議你不要用膠回收kit,回收的DNA可能還有鹽,導致電擊時放電時間很短。 5個電轉(zhuǎn)化方案 方法一:高效 1.收集菌體 取1mlGS115過夜培養(yǎng)物(OD約6-10) 分裝到1.5ml EP管中,4℃、10000g 離心1min,棄上清,沉淀用無菌水(4℃)洗滌,同樣條件下離心,棄上清。 2.菌體處理 加入1ml處理液,室溫下放置20min。 處理液: 10mM LiAc 10mM DTT 0.6M sorbitol 10mM TrisHCl(pH7.5) 3.離心,棄上清,加入1ml 1M sorbitol ,離心,棄上清, 4.用1M sorbitol洗滌二次,到最終體積約為80μl.(菌體太多可適當棄去部分) 5.加入10μl.經(jīng)過BglⅡ酶切處理的工程質(zhì)粒,混勻后轉(zhuǎn)入 電擊杯中,冰浴5min. 6.電轉(zhuǎn). 1.5kv,25μF,200Ω條件下進行電轉(zhuǎn)。 7.電擊后立刻加入1mL 1M sorbitol,吸出后于30℃培養(yǎng)2h。 8.取一定量涂平板(YPDS + Zeocin,涂布的量分別為100、200微升,剩余的經(jīng)離心處理后全部涂在一個平板上) 有一點要注意的是處理液中的DTT是在使用前加入,其它配好后于4度保存,DTT單獨于-20度保存,可配成100倍的貯備液。 |
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方法二:按下面步驟轉(zhuǎn)化,開始每個板子只長了一二十菌落;小細節(jié)修改后,每個板長了約100個. 步驟如下: 1、目的DNA(pPIC9K),經(jīng)電泳檢測已經(jīng)線性化(SalI酶切); 2、DNA純化方法是經(jīng)酚仿-氯仿兩步抽提后,無水乙醇沉淀的,目測定量應足夠; 3、GS115甘油菌經(jīng)新鮮平板復蘇后,5ML培養(yǎng)過夜,16h左右后,取菌1:100稀釋,接種于70ml菌液擴大培養(yǎng),14h后測得OD600約1.3左右。 4、將sorbital、水和菌液均冰; 5、菌液離心5min-100ml冰水洗滌-50ml冰水洗滌-4ml sorbital洗滌,然后溶解于300ul冰sorbital; 6、加入約5~10ug的DNA,槍吹勻,置0.2CM電轉(zhuǎn)杯靜置5min; 7、電擊,1,5KV. 8、立即加入1ml冰浴的sorbital,靜止10min。 9、取100ul轉(zhuǎn)化液,涂布10cm的MD平板。 做了一點修改每塊板子大概能長100來個菌落(一般需要2天左右): 1、菌液收集時間:以前可能是OD值測得不太準確,我然后把菌液分別做了1、2、4、8、16倍稀釋,看其OD值是否呈線性關(guān)系。1、菌液測OD值時,建議將菌液稀釋不同濃度測定,這樣才準確些。菌液看上去渾濁,但OD值不高,很可能就是你的OD稀釋倍數(shù)不夠!你分別稀釋2倍、4倍、8倍、10倍等,每個倍數(shù)做3-5個重復,應該可以大致推斷OD值是否準確! 2、我開始是先挑單克隆于5mlYPD中,過夜16h后,轉(zhuǎn)接于50ml YPD中,培養(yǎng)大概18個小時吧。OD值是否測準可以這樣估算:OD600為40左右時,菌體濕重(6000rpm離心5min)約0.95g/10ml。高密度發(fā)酵時菌體濕重將相應下降。[測OD,用什么作空白對照呢?菌體稀釋液,我一般使用PBS] 3、電擊條件等上面帖子上都有,1.5kv,放電4.8~5.5ms。 2、其它做法相同,就是感受態(tài)做好后,最后一次吸出sorbital時,不是直接倒調(diào)的,而是用毛細管輕吸出來的,這樣可能使剩下的感受態(tài)純凈些。 3、最后用毛細管取出100ul出來,加入質(zhì)粒,混勻!(我以前怕量不夠,吸得很多,電轉(zhuǎn)時效果反而不好。 ) 4、MD板子提前幾天做好,放在冰箱里,涂板的時候吸收效果會好些。如果是新板子,可能吸收不是太好,板子上有些積層,反而不利于生長。 5、你說的YNB,我用的是成品,只需要直接配制。42度水浴一會,然后過濾除菌。我沒有加硫酸銨。YNB是加到培養(yǎng)基里面的,去離子水pH偏低哦,我建議直接用蒸餾水就可以了(關(guān)系不是太大)。 方法三:簡便獨特 在篩選高表達菌種中,與大多數(shù)人和說明書有區(qū)別(成功做出幾個基因): 每次轉(zhuǎn)化前,均用多種酶BlgII/salI/sacI同時切,轉(zhuǎn)化時,用GS115/KM71/KM71H同時轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)化的條件也和大家一樣,即1.5/25/200,但是我用的是0.1的杯子,不是0.2的,轉(zhuǎn)化后涂MM及YPD+0.25G,長出菌落后,即進行大規(guī)模的表達試驗,直接用YPD表達的,一般48h后即進行大量的SDS-PAGE鑒定,鑒定時,樣品不用濃縮,直接上樣,看到目的帶后再做PCR,測序。 方法四:沒有轉(zhuǎn)化子(無aa的YNB和硫酸銨稱好后,去離子水溶解,然后高壓滅菌) 1.挑取酵母單菌落,接種至含有50ml YPD培養(yǎng)基的三角瓶中,30℃、250-300rpm培養(yǎng)過夜約14h,OD600約1.3 2.菌液離心5min-50ml冰水洗滌-25ml冰水洗滌-2ml sorbital洗滌,然后溶解于200ul冰sorbital;兩管分裝,每管100ul 3.加入約5~10ug的線性化的DNA20ul,槍吹勻,置0.2CM電轉(zhuǎn)杯冰浴5min; 4.電擊,1,5KV.使用的是 Eppendorf 2510,用于轉(zhuǎn)化細菌及酵母。 5.立即加入1ml冰浴的sorbital,靜止1h。 將菌體懸液涂布于MD平板上,每300µl涂布一塊平板; 方法五: 和Invitrogen公司說明書差不多的方法 X33菌株于100ml YPD搖到OD600約1.1-1.3,太高影響感受態(tài)效率 (1) 1500-1700g離心5min,將離心管倒置在吸水紙上輕輕控幾下,充分棄上清 (2) 加入100ml 冰浴的超純水ddH2O,可在振蕩器上振蕩混勻,可靜置3-5分鐘 (3) 離心,棄上清,再加100ml ddH2O洗一遍 (4) 離心,棄上清,加20ml 冰浴1M Sorbitol洗一遍 (5) 離心,棄上清,菌體置于冰浴中,加入約100-200ul Sorbitol混勻 加入Sorbitol量需自己調(diào)整,這時菌液很濃,只要能夠用200ul黃槍頭吸出來就可以了,一般共有約400-500ul,夠做幾管感受態(tài)了。 (7) 吸取100-150ul感受態(tài)到線性化的DNA中,用槍頭打勻或手指彈勻 靜置5min,于2mm電轉(zhuǎn)化杯中,電擊參數(shù):1.5KV,25uF,200歐姆(不是400),一般放電時間在4.5-4.9ms之間,小于4說明你的DNA鹽濃度太高 (9) 立即加入1ml Sorbitol,轉(zhuǎn)入10ml 離心管,30度靜置1小時,然后加入1ml YPD,30度,200rpm搖1小時,取50-200ul菌液涂100ul/ml YPDS板 (10) 一般轉(zhuǎn)化效率可以達到:200個以上轉(zhuǎn)化子每200ul菌液,足夠篩選表達菌株了。 方法六:酵母感受態(tài)細胞的制備 ⑴ 接種Pichia pastoris GS115于5 ml YPD液體培養(yǎng)基,30℃,250~300250 rpm ,過夜。 ⑵ 取200µl的培養(yǎng)物接種至含有500ml新鮮培養(yǎng)基的三角搖瓶中,28~30℃、250~300r/min培養(yǎng)過夜,一般12小時左右。 ⑶ 將細胞培養(yǎng)物于4℃,5000g離心5min,用500ml的冰預冷的無菌水將菌體沉淀重懸; ⑷ 按步驟3離心,用250ml的冰預冷的無菌水將菌體沉淀重懸; ⑸ 按步驟3離心,用20ml的冰預冷的1M的山梨醇溶液將菌體沉淀重懸; ⑹ 按步驟3離心,用1ml的冰預冷的1M的山梨醇溶液將菌體沉淀重懸,其終體積約為2ml; ⑺ NOTE:可將其分裝為200µl一份的包裝冷凍起來,但如果保存時間過長會影響其轉(zhuǎn)化效率。 |
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化學轉(zhuǎn)化 畢氏酵母氯化鋰轉(zhuǎn)化法 試劑 1. 1M LiCl:用去離子蒸餾水配制,濾膜過濾除菌;必要時用消毒去離子水稀釋 2. 50% PEG3350 :Sigma P3640 用去離子蒸餾水配制,濾膜過濾除菌,用較緊的蓋子的瓶子分裝 3. 2mg/ml salmon sperm DNA / TE(10mM Tris-Cl, pH8.0, 1.0mM EDTA)-20℃保存 注:醋酸鋰對畢氏酵母無效,僅氯化鋰有效;PEG3350可屏蔽高濃度LiCl的毒害作用; 畢氏酵母的轉(zhuǎn)化 1. 煮沸1ml鮭魚精DNA 5min,迅速冰浴以制備單鏈擔體DNA; 2. 將感受態(tài)酵母菌離心,以Tips去除殘余的LiCl溶液; 3. 對于每一個轉(zhuǎn)化,按以下順序加入: 50% PEG3350 240ul 1M LiCl 36ul 2mg/ml 單鏈Salmon sperm DNA 25ul 5~10ug/50ul H2O 質(zhì)粒DNA 50ul 4. 劇烈旋渦混勻直至沉淀菌體完全分布均勻(約1min); 5. 30℃水浴孵育30min; 6. 42℃水浴熱休克20~25min; 7. 6000~8000rpm離心收集酵母菌體; 8. 重懸酵母于1ml YPD培養(yǎng)基,30℃搖床孵育; 9. 1~4h后,取25~100ul菌液鋪選擇性培養(yǎng)基平板,于30℃培養(yǎng)2~3天鑒定(將表達菌株和對照菌株在固體培養(yǎng)基平板,30'c培養(yǎng)至轉(zhuǎn)化子出現(xiàn)) 畢氏酵母PEG1000轉(zhuǎn)化法 試劑 緩沖液A:1.0M Sorbitol,10mM Bicine,pH8.35(sigma),3%(v/v)ethylene glycol 緩沖液B:40%(w/v)PEG1000(sigma),0.2M Bicine,pH8.35 緩沖液C:0.15M NaCl,10mM Bicine,pH8.35 未污染的新鮮、試劑級DMSO,-70℃保存 注:1. 緩沖液A、B、C均用濾膜過濾,-20℃保存; 2. 將DNA直接加在凍結(jié)的酵母細胞上是本實驗的關(guān)鍵之處(即使在冰上解凍的待轉(zhuǎn)化細胞,其攝取外源DNA的能力也在解凍過程中迅速下降;如進行多樣品的轉(zhuǎn)化,建議按6樣品/組進行); 待轉(zhuǎn)化畢氏酵母的制備 1. 接種環(huán)接種Pachia pastoris于YPD平板,30℃培養(yǎng)2d; 2. 挑取單克隆酵母菌株于10mlYPD培養(yǎng)基中,30℃振蕩培養(yǎng)過夜; 3. 取步驟2中小量菌液接種到100mlYPD培養(yǎng)基中振蕩培養(yǎng),待其OD值從0.1升到0.5~0.8; 4. 室溫下3000g離心收集酵母菌體,50ml緩沖液A洗滌一次; 5. 重懸菌體于4ml緩沖液A中,按0.2ml/管分裝于1.5ml的離心管中,每管加入11ulDMSO,混合后迅速于液氮中冷凍, 6. -70℃保存 畢氏酵母的轉(zhuǎn)化 1. 將約50ug線性化質(zhì)粒DNA溶于20ul TE或水中,直接加于凍結(jié)的酵母細胞中;加入擔體DNA(40ug變性超聲線性化鮭魚精DNA)以獲得最大轉(zhuǎn)化率; 2. 37℃水浴孵育5min,中間混合樣品1~2次; 3. 取出離心管,加入1.5ml緩沖液B,徹底混勻; 4. 30℃水浴孵育1h; 5. 室溫下2000g離心10min,去除上清液,菌體沉淀重懸于1.5ml緩沖液C中; 6. 離心樣品,去除上清液,輕微操作將樣品重懸于0.2ml緩沖液C中; 7. 將所有轉(zhuǎn)化液鋪于選擇性平板,于30℃孵育3~4天后,鑒定; 畢赤酵母轉(zhuǎn)化方法有4 種 。最常用的是電轉(zhuǎn)化法和原生質(zhì)體法,其中電轉(zhuǎn)化法最為方便,轉(zhuǎn)化效率最高,最容易產(chǎn)生多拷貝整合。由于原生質(zhì)體法必須首先制備去除細胞壁的原生質(zhì)體細胞以利于DNA 進入,然后細胞再生細胞壁,產(chǎn)生轉(zhuǎn)化體,而ZeocinR 抑制細胞壁的形成,導致不能產(chǎn)生轉(zhuǎn)化體。因此利用ZeocinR 作為選擇標記的載體如p PICZ 系列,不能使用原生質(zhì)體法進行轉(zhuǎn)化。 資料來源:www.yiqi120.com |
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