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pinebj金蟲 (初入文壇)
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[交流]
【求助】過渡態(tài)出現(xiàn)2個(gè)虛頻 已有2人參與
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大家好， 我優(yōu)化得到的過渡態(tài)做頻率分析時(shí)有兩個(gè)虛頻，750i，115i，其中750i正是我要的，但是如何消除115i這個(gè)虛頻呢？謝謝！ |
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zhangmt
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| 如果你有g(shù)view4.0以上的版本，打開log文件，顯示頻率，然后選中你不要的那個(gè)虛頻，在最下面那個(gè)"Manual Displacement"，然后在拖動(dòng)滑竿，或直接在右面文本框輸入數(shù)字（一般在0.2-0.8）之間，我習(xí)慣用0.2或0.3,然后點(diǎn)擊右面的存儲(chǔ)按鈕"Save Structure",，就會(huì)生成一個(gè)新的坐標(biāo)文件gjf，用這個(gè)繼續(xù)跑opt，不要的那個(gè)虛頻多數(shù)都能去掉了。記住要4.0以上，3.x的版本沒有這個(gè)功能，需要自己手工計(jì)算虛頻的坐標(biāo)，然后乘以一個(gè)系數(shù)（也就是我說(shuō)的那個(gè)0.2或0.3）再去修改所有原子的坐標(biāo)。 |
5樓2009-12-25 15:32:28
10樓2010-08-18 13:48:14
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| 哦，給你一個(gè)更簡(jiǎn)單的方法。首先看清楚不要的那個(gè)虛頻的振動(dòng)方向，然后按照主要振動(dòng)原子的振動(dòng)方向?qū)⒃游灰�，這就會(huì)破壞那個(gè)虛頻的振動(dòng)，更多的時(shí)候是破壞了對(duì)稱性。然后用新的坐標(biāo)再優(yōu)化時(shí)，就會(huì)得到正確的了。用Chem3D和GaussView都可以做，也可以根據(jù)虛頻的相對(duì)各原子運(yùn)動(dòng)強(qiáng)度將位移直接加到最后的坐標(biāo)中。 |
6樓2009-12-25 15:42:54
pinebj
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9樓2010-08-17 16:03:48
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