 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 4163 | 回復(fù): 12 | |||||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | |||||
ljyang320木蟲 (正式寫手)
小書蟲愛吃糖
|
[交流]
【求助】discover 里面怎么分析氫鍵的鍵角和鍵長分布 已有7人參與
|
||||
| 請問MS里面的模塊中怎么對氫鍵鍵長個鍵角分布函數(shù)進(jìn)行分析�。� |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 xuexijisuan | methylation |
» 猜你喜歡
362求調(diào)劑
已經(jīng)有14人回復(fù)
-
求調(diào)劑 302分初試 0854
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
299求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
266分，一志愿電氣工程，本科材料，求材料專業(yè)調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
312求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
315求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
土木304求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
316求調(diào)劑
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
一志愿華東理工大學(xué)，080500學(xué)碩，317分，求調(diào)劑
已經(jīng)有13人回復(fù)
-
材料與化工306分找調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 鍵角是怎么保持的？
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 純度角怎么看的
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 怎樣用forcite畫徑向分布函數(shù)
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 求大牛指導(dǎo)求鍵角分布
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 氨基和醚氧鍵鍵形成氫鍵嗎
已經(jīng)有9人回復(fù)
- MS Discover 動力學(xué)求助
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 報道鍵長和鍵角時該怎樣寫精確度？
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 水分子在外場下鍵角、鍵長的變化？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 用Shelxtl 弄出鍵長、鍵角數(shù)據(jù)
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 布局分析 鍵布局 系統(tǒng)分析
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 水上加氫精修后，氫鍵的鍵長總有變化，如何解決？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 怎么從解析的文件判斷氫鍵？
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 酯鍵之間是否有氫鍵存在
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 求解Cd-N鍵的鍵長范圍
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助】AUTODOCK 產(chǎn)生的氫鍵原理~
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助】鍵長鍵角等固定后的優(yōu)化..懸賞30...【已經(jīng)解決～感謝～】
已經(jīng)有22人回復(fù)
- 【求助】怎么從結(jié)果中提取徑向分布函數(shù)、鍵長、鍵角
已經(jīng)有17人回復(fù)
- 【討論】大家討論下計算弱鍵的方法-氫鍵，鹵鍵
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】怎么判斷氫鍵強(qiáng)弱對共價鍵的影響
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助】MS下怎么看鍵角大小
已經(jīng)有4人回復(fù)
yjmaxpayne
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 貴賓: 2.711
- 金幣: 2178.5
- 紅花: 3
- 沙發(fā): 2
- 帖子: 521
- 在線: 79.8小時
- 蟲號: 137998
- 注冊: 2005-12-18
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
3樓2010-03-09 12:37:30
yjmaxpayne
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 貴賓: 2.711
- 金幣: 2178.5
- 紅花: 3
- 沙發(fā): 2
- 帖子: 521
- 在線: 79.8小時
- 蟲號: 137998
- 注冊: 2005-12-18
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
★ ★
ljyang320(金幣+5):多謝，我試過這樣的弄發(fā)，結(jié)果不成功 2010-03-09 11:51
zxzj05(金幣+2):謝謝回帖交流 2010-03-09 21:21
ljyang320(金幣+5):多謝，我試過這樣的弄發(fā)，結(jié)果不成功 2010-03-09 11:51
zxzj05(金幣+2):謝謝回帖交流 2010-03-09 21:21
|
對于氫鍵鍵長，你這個情況的話，可能需要結(jié)合Scripting （具體可以在help中輸入hydrogen bond來獲取需要的信息）來進(jìn)行分析， 或者是你在進(jìn)行動力學(xué)演化之前， 把所有氫鍵鍵長給測量出來，然后建立一個set。 動力學(xué)演化之后， 就可以直接使用Discover或者Forcite中Analysis---> structural (discover) / length distribution (forcite) 來進(jìn)行分析了。 如果只是靜態(tài)結(jié)構(gòu)的話， forcite中的length distribution可能更好些。 同理， 鍵角也是類似的做法，最好是測量出來后進(jìn)行分析， forcite中同樣也有Angle distribution的工具。 希望能夠?qū)δ阌兴鶐椭?br /> [ Last edited by yjmaxpayne on 2010-3-9 at 11:46 ] |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
貓頭鷹love2樓2010-03-09 11:45:30
yjmaxpayne
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 貴賓: 2.711
- 金幣: 2178.5
- 紅花: 3
- 沙發(fā): 2
- 帖子: 521
- 在線: 79.8小時
- 蟲號: 137998
- 注冊: 2005-12-18
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
aylayl08(金幣+8):非常感謝專家指點 2010-03-11 10:34
ljyang320(金幣+15):嗯，這是個好辦法，你說的很對，對于少量的很方便但是對于很多酒麻煩的。materials scripting來進(jìn)行測量該怎么操作呢？ 2010-03-11 19:24
aylayl08(金幣+8):非常感謝專家指點 2010-03-11 10:34
ljyang320(金幣+15):嗯，這是個好辦法，你說的很對，對于少量的很方便但是對于很多酒麻煩的。materials scripting來進(jìn)行測量該怎么操作呢？ 2010-03-11 19:24
|
鍵角的關(guān)鍵在于你如何定義了， 據(jù)我估計，你想要研究的氫鍵鍵角是不是可以認(rèn)為是有一個高電負(fù)性中心原子然后臨近兩個極性分子上各貢獻(xiàn)一個H原子而形成的？ 例如：import -> structures -> molecular crystals -> drugs -> histidine_resolved.xsd 這個結(jié)構(gòu)中就有H...Cl...H這樣的氫鍵存在， 所以可以通過常用的鍵角測量方法得到這類型氫鍵的鍵角。 測量方法就不多說了， 關(guān)鍵是測量好以后， 需要按住alt鍵然后鼠標(biāo)雙擊某個鍵角數(shù)值， 這樣就可以全選鍵角， 之后在edit -> edit sets 中 對這些鍵角新建一個set， 然后就可以使用Forcite -> Analysis -> Angle distribution 對其進(jìn)行分析了。 我這個方法可能在鍵角數(shù)量較小的時候還比較方便，如果體系很大， 可能就需要考慮結(jié)合materials scripting來進(jìn)行測量和分析了。 希望能對你有所幫助。 [ Last edited by yjmaxpayne on 2010-3-11 at 10:15 ] |
4樓2010-03-11 10:13:32
xk6891
至尊木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 13735.8
- 散金: 379
- 紅花: 9
- 帖子: 1514
- 在線: 546小時
- 蟲號: 890342
- 注冊: 2009-11-01
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
5樓2011-04-01 21:27:04
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 330分求調(diào)劑 +13 | qzenlc 2026-03-29 | 13/650 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 材料調(diào)劑 +6 | 懶羊羊輕置玉臀 2026-04-02 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 275學(xué)碩081000服從調(diào)劑到其他專業(yè)，保不住本專業(yè)了 +7 | 一只小小水牛 2026-04-02 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 材料工程322分 +8 | 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-01 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿北交大材料工程總分358 +8 | cs0106 2026-04-01 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 土木304求調(diào)劑 +6 | 兔突突突， 2026-03-31 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿北交大材料工程，總分358 +4 | cs0106 2026-04-01 | 4/200 |
|
|
[考研] 英一數(shù)一408，總分284，二戰(zhàn)真誠求調(diào)劑 +12 | 12.27 2026-03-30 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +5 | dfffsar 2026-03-29 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 085600，320分求調(diào)劑 +5 | 大饞小子 2026-04-01 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 353求調(diào)劑 +4 | 拉鉤不許變 2026-04-01 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +4 | DADA怪 2026-03-31 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 安徽大學(xué)專碩生物與醫(yī)藥專業(yè)(086000)324分，英語已過四六級，六級521，求調(diào)劑 +10 | 美味可樂雞翅 2026-03-26 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 086000生物與醫(yī)藥298調(diào)劑求助 +4 | 元元青青 2026-03-31 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 085601 329分調(diào)劑 +6 | yzsa12 2026-03-31 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 085600，專業(yè)課化工原理，320分求調(diào)劑 +6 | 大饞小子 2026-03-29 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 083000學(xué)碩274求調(diào)劑 +12 | Li李魚 2026-03-26 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 285求調(diào)劑 +6 | AZMK 2026-03-29 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 342求調(diào)劑 +4 | 加油a李zs 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +7 | 青春裁為三截 2026-03-29 | 7/350 |
|