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【求助】dmol搜索過(guò)渡態(tài)的出現(xiàn)固定原子無(wú)法配對(duì)問(wèn)題 已有1人參與
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請(qǐng)教大家一個(gè)問(wèn)題： 在搜索過(guò)渡態(tài)時(shí)候出現(xiàn)這個(gè)問(wèn)題 Error: Fixed coordinate mismatch: 2.195527 2.442696 Error: Fixed coordinates should match in both structures to within 0.0010 Message: DMol3 job failed Error: DMol3 exiting 我在反應(yīng)物和生成物中都有固定原子，可是我一一對(duì)照了 反應(yīng)物和產(chǎn)物中固定原子的坐標(biāo)都是一樣的，在進(jìn)行原子配對(duì)的時(shí)候沒(méi)有出現(xiàn)問(wèn)題 可是一運(yùn)算就出現(xiàn)這個(gè)錯(cuò)誤，要是固定原子的坐標(biāo)不一樣，在原子配對(duì)的時(shí)候就應(yīng)該沒(méi)辦法進(jìn)行，為什么我能進(jìn)行原子配對(duì)，當(dāng)運(yùn)行計(jì)算的時(shí)候仍會(huì)出現(xiàn)這個(gè)問(wèn)題呢？希望大家能幫幫我 |
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aylayl08(金幣+2):謝謝你的建議歡迎討論 2010-03-19 08:06
水月慧心(金幣+1): 2010-07-07 12:31:03
aylayl08(金幣+2):謝謝你的建議歡迎討論 2010-03-19 08:06
水月慧心(金幣+1): 2010-07-07 12:31:03
| 這個(gè)錯(cuò)誤我也遇到過(guò)，明明是固定了，但是反應(yīng)物和產(chǎn)物都會(huì)有坐標(biāo)變化。我的做法是，取優(yōu)化后的反應(yīng)物（或產(chǎn)物），重新構(gòu)建產(chǎn)物（或反應(yīng)物）來(lái)進(jìn)行優(yōu)化計(jì)算，最后得到的結(jié)構(gòu)再去拿來(lái)配對(duì)找過(guò)渡態(tài)。 |
2樓2010-03-18 21:55:21
3樓2010-07-07 12:30:58
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5樓2013-08-12 10:42:18
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