 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 查看: 2727 | 回復(fù): 12 | |||||
souledge專家顧問 (著名寫手)
|
[交流]
【求助】CASTEP做Dynamic時(shí)晶體易變…… 已有4人參與
|
||||
|
本人課題與熱力學(xué)等問題聯(lián)系比較多，所以想用CASTEP中的Dynamic來求得不同晶體的熱力學(xué)數(shù)據(jù)（關(guān)鍵是吉布斯函數(shù)）。 后來看到了小木蟲計(jì)算版期刊第一期中wenhua luo和lei0736的《自由能的分子動力學(xué)計(jì)算》一文，開始按照里面的步驟學(xué)習(xí)使用Dynamic來模擬計(jì)算。 在內(nèi)能模擬時(shí)，先從MS的數(shù)據(jù)庫中直接導(dǎo)入了Ag，然后擴(kuò)展到8x8x8的結(jié)構(gòu)，再M(fèi)ake P1。然后按照文章中的步驟，選擇NPT系綜，每個(gè)時(shí)間步為2fs，溫度為300K，然后開始計(jì)算。結(jié)果總是在進(jìn)行幾個(gè)時(shí)間步后就提示晶體易變，任務(wù)失敗。 為了加快全流程速度，改為設(shè)置了10fs為一個(gè)時(shí)間步，共100時(shí)間步，Thermostat使用Nose，Barostat使用Andersen，并且為固定了質(zhì)心（Fix center of mass）。并且為了增強(qiáng)收斂性，加大了截?cái)嗄�，并且使用�?x8x8的K點(diǎn)設(shè)置。采用LDA超軟贗勢進(jìn)行計(jì)算，結(jié)果依然有錯(cuò)誤提示： 順便看了一下結(jié)果圖，的確這個(gè)突變有點(diǎn)太那啥了……  由于是工科背景，對于贗勢之類的理論比較空白，雖然在惡補(bǔ)，但是暫時(shí)依然杯水車薪。哪位高人可以幫忙指出一下，上面的那些步驟，都有哪些問題么…… |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
一志愿天大材料與化工（085600）總分338
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
085700資源與環(huán)境308求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
求材料調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
294求調(diào)劑材料與化工專碩
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿華中科技大學(xué)，080502，354分求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
一志愿吉林大學(xué)材料學(xué)碩321求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
085410人工智能專碩317求調(diào)劑（0854都可以）
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
330求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿中海洋材料工程專碩330分求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
304求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:
- CASTEP對優(yōu)化后的晶體進(jìn)行分態(tài)密度分析，應(yīng)該怎么操作
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 用特定的面去切割CASTEP建立的晶體
已經(jīng)有5人回復(fù)
- castep計(jì)算的晶體結(jié)構(gòu)，bands無帶隙而dos里面有，如何認(rèn)定材料？castep遇到導(dǎo)體?
已經(jīng)有9人回復(fù)
- CASTEP建模方法：虛擬晶體近似(VCA)
已經(jīng)有498人回復(fù)
- MS 中的CASTEP可以計(jì)算強(qiáng)關(guān)聯(lián)體系的晶體結(jié)構(gòu)（如VO2)嗎？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【求助】CASTEP 增加壓強(qiáng)是晶體結(jié)構(gòu)變化？如何設(shè)置？
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】CASTEP中怎樣構(gòu)建晶體聚合物呢？
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【求助】用MS中的castep模塊計(jì)算晶體
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 【求助】CASTEP 分子晶體建結(jié)構(gòu)
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助】用CASTEP計(jì)算晶體時(shí)結(jié)構(gòu)問題
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助】castep建立晶體結(jié)構(gòu)時(shí)出現(xiàn)孤立的原子是怎么回事
已經(jīng)有3人回復(fù)
zzy870720z
榮譽(yù)版主 (文壇精英)
- 1ST強(qiáng)帖: 3
- 應(yīng)助: 47 (小學(xué)生)
- 貴賓: 9.05
- 金幣: 30914.3
- 散金: 5613
- 紅花: 68
- 沙發(fā): 99
- 帖子: 12592
- 在線: 23567.6小時(shí)
- 蟲號: 745488
- 注冊: 2009-04-10
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性I:結(jié)構(gòu)、力學(xué)和
- 管轄: 分子模擬
4樓2010-04-28 12:37:26
zzy870720z
榮譽(yù)版主 (文壇精英)
- 1ST強(qiáng)帖: 3
- 應(yīng)助: 47 (小學(xué)生)
- 貴賓: 9.05
- 金幣: 30914.3
- 散金: 5613
- 紅花: 68
- 沙發(fā): 99
- 帖子: 12592
- 在線: 23567.6小時(shí)
- 蟲號: 745488
- 注冊: 2009-04-10
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性I:結(jié)構(gòu)、力學(xué)和
- 管轄: 分子模擬
2樓2010-04-28 12:23:31
souledge
專家顧問 (著名寫手)
-
專家經(jīng)驗(yàn): +174 - 1ST強(qiáng)帖: 19
- 應(yīng)助: 303 (大學(xué)生)
- 金幣: 11306.4
- 散金: 1123
- 紅花: 108
- 帖子: 2814
- 在線: 916.1小時(shí)
- 蟲號: 941486
- 注冊: 2010-01-12
- 專業(yè): 結(jié)構(gòu)陶瓷
- 管轄: 第一性原理
3樓2010-04-28 12:33:17
souledge
專家顧問 (著名寫手)
-
專家經(jīng)驗(yàn): +174 - 1ST強(qiáng)帖: 19
- 應(yīng)助: 303 (大學(xué)生)
- 金幣: 11306.4
- 散金: 1123
- 紅花: 108
- 帖子: 2814
- 在線: 916.1小時(shí)
- 蟲號: 941486
- 注冊: 2010-01-12
- 專業(yè): 結(jié)構(gòu)陶瓷
- 管轄: 第一性原理
5樓2010-04-28 12:54:04
zzy870720z
榮譽(yù)版主 (文壇精英)
- 1ST強(qiáng)帖: 3
- 應(yīng)助: 47 (小學(xué)生)
- 貴賓: 9.05
- 金幣: 30914.3
- 散金: 5613
- 紅花: 68
- 沙發(fā): 99
- 帖子: 12592
- 在線: 23567.6小時(shí)
- 蟲號: 745488
- 注冊: 2009-04-10
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性I:結(jié)構(gòu)、力學(xué)和
- 管轄: 分子模擬
6樓2010-04-28 13:03:58
souledge
專家顧問 (著名寫手)
-
專家經(jīng)驗(yàn): +174 - 1ST強(qiáng)帖: 19
- 應(yīng)助: 303 (大學(xué)生)
- 金幣: 11306.4
- 散金: 1123
- 紅花: 108
- 帖子: 2814
- 在線: 916.1小時(shí)
- 蟲號: 941486
- 注冊: 2010-01-12
- 專業(yè): 結(jié)構(gòu)陶瓷
- 管轄: 第一性原理
 有變化/波動到是不在乎，可是問題在于，這個(gè)錯(cuò)誤提示：Error in md_vv1_npt_nose - cell inconsistency? Current trace stack: md_vv1_npt_nose md_run castep Error in md_vv1_npt_nose - cell inconsistency? Current trace stack: md_vv1_npt_nose md_run castep MPI Application rank 3 exited before MPI_Finalize() with status 1 這是失敗后的castep文件的末尾顯示的錯(cuò)誤信息……偶就是不明白為什么總會有這么個(gè)信息…… 至于那兩個(gè)圖，是因?yàn)橥ㄟ^觀察，有上述錯(cuò)誤信息時(shí)，在Motion和Temp的兩個(gè)圖中，至少有一個(gè)會發(fā)生劇烈變化……不過，這個(gè)沒關(guān)系，可以不care的說……重點(diǎn)還是在于為什么MD的計(jì)算會以cell inconsistency的問題失敗…… |
7樓2010-04-28 13:20:44
souledge
專家顧問 (著名寫手)
-
專家經(jīng)驗(yàn): +174 - 1ST強(qiáng)帖: 19
- 應(yīng)助: 303 (大學(xué)生)
- 金幣: 11306.4
- 散金: 1123
- 紅花: 108
- 帖子: 2814
- 在線: 916.1小時(shí)
- 蟲號: 941486
- 注冊: 2010-01-12
- 專業(yè): 結(jié)構(gòu)陶瓷
- 管轄: 第一性原理
咋沒人回帖了捏…… 8樓2010-04-28 17:17:55
zzy870720z
榮譽(yù)版主 (文壇精英)
- 1ST強(qiáng)帖: 3
- 應(yīng)助: 47 (小學(xué)生)
- 貴賓: 9.05
- 金幣: 30914.3
- 散金: 5613
- 紅花: 68
- 沙發(fā): 99
- 帖子: 12592
- 在線: 23567.6小時(shí)
- 蟲號: 745488
- 注冊: 2009-04-10
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性I:結(jié)構(gòu)、力學(xué)和
- 管轄: 分子模擬
9樓2010-04-28 18:11:51
franch
版主 (著名寫手)
- 1ST強(qiáng)帖: 2
- 應(yīng)助: 62 (初中生)
- 貴賓: 0.185
- 金幣: 7766.8
- 散金: 2986
- 紅花: 23
- 沙發(fā): 2
- 帖子: 1964
- 在線: 731.1小時(shí)
- 蟲號: 587928
- 注冊: 2008-08-22
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
- 管轄: 第一性原理
10樓2011-04-03 19:38:08
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 souledge 的主題更新
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 267一志愿南京工業(yè)大學(xué)0817化工求調(diào)劑 +8 | SUICHILD 2026-03-12 | 8/400 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 328求調(diào)劑，英語六級551，有科研經(jīng)歷 +3 | 生物工程調(diào)劑 2026-03-16 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 材料專業(yè)求調(diào)劑 +5 | hanamiko 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +7 | 妮妮ninicgb 2026-03-15 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 【同濟(jì)軟件】軟件（085405）考研求調(diào)劑 +3 | 2026eternal 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +6 | 26研0 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料與化工一志愿南昌大學(xué)327求調(diào)劑推薦 +8 | Ncdx123456 2026-03-13 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 材料，紡織，生物（0856、0710），化學(xué)招生啦 +3 | Eember. 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +3 | 冷笙123 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 環(huán)境工程調(diào)劑 +8 | 大可digkids 2026-03-16 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 268求調(diào)劑 +7 | 好運(yùn)連綿不絕 2026-03-12 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 268求調(diào)劑 +8 | 一定有學(xué)上- 2026-03-14 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 梁成偉老師課題組歡迎你的加入 +8 | 一鴨鴨喲 2026-03-14 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 0854控制工程 359求調(diào)劑 可跨專業(yè) +3 | 626776879 2026-03-14 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +4 | ahbd 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +3 | 曼殊2266 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +3 | 劉夢微 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +7 | 7712b 2026-03-13 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿211化學(xué)學(xué)碩310分求調(diào)劑 +8 | 努力奮斗112 2026-03-12 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 295求調(diào)劑 +3 | 小匕仔汁 2026-03-12 | 3/150 |
|