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sai00fuji金蟲 (正式寫手)
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[交流]
【求助/交流】codehop設(shè)計(jì)的引物怎么修改？ 已有7人參與
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codehop設(shè)計(jì)的引物在5‘端沒有簡(jiǎn)并，這是他的特點(diǎn)。。。 導(dǎo)師說5’端還是要做簡(jiǎn)并的，畢竟有幾個(gè)位置不同的堿基是1：1分布的。我的擔(dān)心是：這樣子做codehop的特點(diǎn)不就沒了嘛 想問問大家做codehop的時(shí)候是怎么修改引物的 |
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sai00fuji
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2樓2010-05-29 22:32:38
3樓2010-05-29 23:00:12
證明題
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試試genefisher~ http://bibiserv.techfak.uni-biel ... er2/submission.html |
4樓2010-05-30 04:52:05
sai00fuji
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我最近在學(xué)習(xí)設(shè)計(jì)CODEHOP簡(jiǎn)并引物，具體步驟如下： 先在genebank上找到你的目的基因，當(dāng)然這個(gè)基因應(yīng)該是蛋白基因而不是核酸序列； 接著進(jìn)行block比對(duì)，建議結(jié)合clustralW，看保守區(qū)的具體位置； blockmaker下面有CODEHOP鏈接的按鈕，點(diǎn)擊進(jìn)去； 結(jié)合文獻(xiàn)進(jìn)行相應(yīng)參數(shù)的設(shè)置； 然后look for primer； 然后就出來很多結(jié)果，不同的保守區(qū)有不同的很多引物序列，前面的是正向引物，互補(bǔ)的是方向引物，直接合成就行。 至于，如何用OLIGO 6對(duì)引物進(jìn)行評(píng)估，我現(xiàn)在還不會(huì)。 期待高人進(jìn)行解釋！  |
9樓2012-09-02 09:12:09
10樓2014-01-09 18:04:40
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