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sai00fuji金蟲 (正式寫手)
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[交流]
【求助/交流】codehop設(shè)計(jì)的引物怎么修改？ 已有7人參與
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codehop設(shè)計(jì)的引物在5‘端沒有簡并，這是他的特點(diǎn)。。。 導(dǎo)師說5’端還是要做簡并的，畢竟有幾個位置不同的堿基是1：1分布的。我的擔(dān)心是：這樣子做codehop的特點(diǎn)不就沒了嘛 想問問大家做codehop的時候是怎么修改引物的 |
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ample1007
銀蟲 (初入文壇)
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
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我最近在學(xué)習(xí)設(shè)計(jì)CODEHOP簡并引物，具體步驟如下： 先在genebank上找到你的目的基因，當(dāng)然這個基因應(yīng)該是蛋白基因而不是核酸序列； 接著進(jìn)行block比對，建議結(jié)合clustralW，看保守區(qū)的具體位置； blockmaker下面有CODEHOP鏈接的按鈕，點(diǎn)擊進(jìn)去； 結(jié)合文獻(xiàn)進(jìn)行相應(yīng)參數(shù)的設(shè)置； 然后look for primer； 然后就出來很多結(jié)果，不同的保守區(qū)有不同的很多引物序列，前面的是正向引物，互補(bǔ)的是方向引物，直接合成就行。 至于，如何用OLIGO 6對引物進(jìn)行評估，我現(xiàn)在還不會。 期待高人進(jìn)行解釋！  |
9樓2012-09-02 09:12:09
sai00fuji
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證明題
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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
lstt09nk(金幣+2):熱心蟲友~~感謝交流~~ 2010-05-30 13:28:51
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試試genefisher~ http://bibiserv.techfak.uni-biel ... er2/submission.html |
4樓2010-05-30 04:52:05
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