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【求助】siesta3.0 安裝，錯(cuò)誤一籮筐 已有6人參與
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首先現(xiàn)安裝串行，ifort 10， mkl 10， 裝siesta，make通過， make clean ， make transiesta，出現(xiàn) m_forces.o m_stress.o m_eo.o m_spin.o m_gamma.o m_hsx.o m_fire.o get_target_stress.o fire_optim.o zm_fire_optim.o cell_fire_optim.o m_fire_para.o m_fire_mixing.o write_raw_efs.o m_iodm.o m_sparse.o kpoint_pdos.o nag.o pxf.o m_ts_options.o m_ts_aux_rout.o m_ts_kpoints.o m_ts_io.o m_ts_scattering.o m_ts_contour.o m_ts_electrode.o m_ts_in_siesta.o libfdf.a \ \ dc_lapack.a liblapack.a libblas.a `FoX/FoX-config --libs --wcml` dc_lapack.a liblapack.a libblas.a m_ts_aux_rout.o: In function `__m_ts_aux_rout__csolveg': /home/hu/software/siesta-3.0-rc1/Src/m_ts_aux_rout.F:344: undefined reference to `zgesv_' collect2: ld 返回 1 make: *** [transiesta] 錯(cuò)誤 1 [hu@node02 trans]$ 個(gè)人以為與數(shù)據(jù)庫有關(guān)，轉(zhuǎn)裝blas，lapack。 安裝lapack-3.2時(shí)，出現(xiàn) Time for 1,000,000 SAXPY ops = 0.00 seconds *** Error: Time for operations was zero Including SECOND, time = 0.00 seconds Average time for SECOND = 0.00 milliseconds Time for 1,000,000 DAXPY ops = 0.00 seconds *** Error: Time for operations was zero Including DSECND, time = 0.00 seconds Average time for DSECND = 0.00 milliseconds 結(jié)果編譯通不過。 后來裝并行時(shí)，又有報(bào)錯(cuò)。 [hu@node01 ~]$ mpdcheck -f mpd.hosts -ssh hu@node03's password: ** ssh timed out to node03 ** ssh failed to node03 ** here is the output: [hu@node01 ~]$ 共有四臺(tái)機(jī)器，只有第一臺(tái)通過了lapack編譯，之后make transiesta通過，但是運(yùn)行例子也是報(bào)錯(cuò)，如下 siesta: 194************** 96726338.0234 96726338.0234143.3913******** siesta: WARNING: Qtot, Tr[D*S] = 156.000000 63.523758 siesta: 195************** 96503554.1989 96503554.1989143.4410******** 整天對(duì)著電腦來來回回的裝呀裝，期待高手指點(diǎn)一二，使我脫離苦海！ |
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7樓2010-06-11 10:13:46
ice_rain
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
2樓2010-06-10 21:22:08
3樓2010-06-10 21:43:06
valenhou001
至尊木蟲 (職業(yè)作家)
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- 注冊: 2010-04-27
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
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大地飛鷹h(金幣+3):謝謝參與
cenwanglai(金幣+2):謝謝回復(fù) 2010-06-13 09:56:20
大地飛鷹h(金幣+3):謝謝參與
cenwanglai(金幣+2):謝謝回復(fù) 2010-06-13 09:56:20
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這類的錯(cuò)誤，多半是由于數(shù)學(xué)庫lapack和blas時(shí)的編譯選項(xiàng)同SIESTA的編譯選項(xiàng)有所不同造成的，特別是有關(guān)是否加下劃線的選項(xiàng)，各個(gè)fortran編譯器對(duì)此處理的默認(rèn)方式略有不同。 如果采用默認(rèn)的編譯選項(xiàng)的話，那么數(shù)學(xué)庫編譯時(shí)的fortran編譯器與SIESTA時(shí)的編譯器都選一樣的。 |
4樓2010-06-11 09:31:51
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