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【求助】gaussian中簡正坐標的輸出 已有2人參與
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在一篇文章《Vibrational Analysis in Gaussian》中說到“The purpose of this document is to describe how Gaussian calculates the reduced mass, frequencies, force constants, and normal coordinates which are printed out at the end of a frequency calculation.”從這句話看normal coordinates應該在計算頻率的時候打印出來了啊，可是不知道哪地方給的是normal coordinates？以H2o為例，計算頻率時的部分輸出為： (Enter /home/gau03/g03/l716.exe) Dipole =-3.44478646D-17-3.96506834D-17-6.72452773D-01 Polarizability= 4.00613449D-02 3.18281559D-16 5.50808430D+00 1.58802971D-16 1.97181875D-16 2.56587227D+00 HyperPolar =-3.59200065D-17-6.27316867D-18-2.96845704D-16 -1.10949459D-14 7.62420726D-02-3.00230546D-16 -7.01237208D+00-1.56024452D-16 2.91713493D-15 -4.11420102D+00 Full mass-weighted force constant matrix: Low frequencies --- -6.0514 -1.0843 -0.0019 -0.0012 -0.0009 4.5788 Low frequencies --- 2170.0372 4140.0019 4391.0737 Diagonal vibrational polarizability: 0.0000000 0.0418305 0.1108974 Harmonic frequencies (cm**-1), IR intensities (KM/Mole), Raman scattering activities (A**4/AMU), depolarization ratios for plane and unpolarized incident light, reduced masses (AMU), force constants (mDyne/A), and normal coordinates:（這里也顯示normal coordinates，但是不知道怎么看，我怎么找不到啊？ 1 2 3 A1 A1 B2 Frequencies -- 2170.0372 4140.0019 4391.0737 Red. masses -- 1.0785 1.0491 1.0774 Frc consts -- 2.9923 10.5941 12.2392 IR Inten -- 7.2379 44.2862 29.9710 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 1 0.00 0.45 0.54 0.00 -0.57 0.42 0.00 0.54 -0.45 2 1 0.00 -0.45 0.54 0.00 0.57 0.42 0.00 0.54 0.45 3 8 0.00 0.00 -0.07 0.00 0.00 -0.05 0.00 -0.07 0.00 謝謝指點。 |
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sobereva
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sobereva
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Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 1 0.00 0.45 0.54 0.00 -0.57 0.42 0.00 0.54 -0.45 2 1 0.00 -0.45 0.54 0.00 0.57 0.42 0.00 0.54 0.45 3 8 0.00 0.00 -0.07 0.00 0.00 -0.05 0.00 -0.07 0.00 這個就是。例如2號原子的X,Y,Z坐標構成第1種簡正坐標的系數(shù)為0.00 -0.45 0.54。 你把這里每個振動模式的3*3矩陣排列成9*1就容易看出簡正坐標與原先3N坐標的關系了。如第一個簡正坐標： 0.00 0.45 0.54 0.00 -0.45 0.54 0.00 0.00 -0.07 [ Last edited by sobereva on 2010-8-1 at 16:18 ] |
2樓2010-08-01 16:04:47
3樓2010-08-01 16:26:12
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