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[交流]
【求助/交流】引物設(shè)計(jì)問題求助！ 已有3人參與
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我在NCBI上找到了一個(gè)基因的mRNA序列，有完整的閱讀框。但是從序列的第5個(gè)堿基開始就是編碼區(qū)，我想從第一個(gè)堿基開始設(shè)計(jì)引物，但是一個(gè)老師說測(cè)序時(shí)前幾十個(gè)堿基都是不可信的，建議設(shè)計(jì)的引物離閱讀框稍微遠(yuǎn)一點(diǎn)，但是閱讀框離現(xiàn)有序列的5‘端太近，請(qǐng)問這引物該怎么設(shè)計(jì)？ 問題2： 我想用現(xiàn)有的這個(gè)mRNA序列在本物種的EST庫中尋找這個(gè)基因的EST序列，然后拼接，想把5’端的序列延長一點(diǎn)，但是當(dāng)我對(duì)比之后發(fā)現(xiàn)有很多的EST序列，我該選用哪些序列進(jìn)行拼接？附圖中這幾個(gè)參數(shù)都表示什么意思？MAX Score,total score;query coverage;E value. N. 今天聽一個(gè)同學(xué)說比較EST的時(shí)候主要看E值，E值多少才算有重疊呢？圖片如下：  |
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- 引物設(shè)計(jì)求助~
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yujiaping1
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4樓2010-08-04 20:56:31
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5樓2012-07-14 22:28:01
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6樓2012-07-15 23:49:16
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