 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2141 | 回復(fù): 10 | ||||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | ||||
[交流]
【求助】求助Gromacs中關(guān)于g_hbond的out文件的問題 已有9人參與
|
||||
| 我的運(yùn)行命令是g_bhond -f 1.xtc -s md.tpr -num num.xvg, 生成了一個(gè)num.xvg文件. 查看這個(gè)文件有3列，第一列是時(shí)間，第二列是氫鍵數(shù)，第三列是pairs within 0.35nm. 我的疑問是，有的時(shí)間對應(yīng)的第三列是0，即pairs within 0.35nm的對數(shù)是0，可是氫鍵的數(shù)目不是0，為什么呢。我覺得如果沒有滿足pairs within 0.35nm這個(gè)條件的，就不應(yīng)該存在氫鍵吧。 |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 氫鍵 |
» 猜你喜歡
南京大學(xué)化學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
材料專碩調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿華東師范大學(xué)有機(jī)化學(xué)專業(yè)，初試351分，復(fù)試被刷求調(diào)劑!
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
283求調(diào)劑（080500）
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
311求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
275求調(diào)劑
已經(jīng)有20人回復(fù)
-
各位老師好，我的一志愿為北京科技大學(xué)085601材料專碩
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
294分080500材料科學(xué)與工程求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
一志愿北京工業(yè)大學(xué)，324分求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿武漢理工，總分321，英一數(shù)二，求老師收留。
已經(jīng)有11人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 【求助】gromacs周期性邊界條件問題
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】如何使用gromacs中的constraint
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】這是我安裝gromacs過程，但是出錯(cuò)阿，這個(gè)怎么辦呢？謝謝
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】gromacs的又一個(gè)問題
已經(jīng)有22人回復(fù)
- 【求助】重金求助：gromacs中g(shù)_rms命令中怎樣應(yīng)用index.ndx文件
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】gromacs出現(xiàn)了一個(gè)問題
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助】求一個(gè)gromacs的中文教程，包括安裝的部分，小弟新手，從零學(xué)起
已經(jīng)有8人回復(fù)
lao7
金蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 22 (小學(xué)生)
- 金幣: 1305.3
- 散金: 30
- 紅花: 5
- 帖子: 787
- 在線: 176.6小時(shí)
- 蟲號: 1041612
- 注冊: 2010-06-14
- 性別: MM
- 專業(yè): 電磁場與電路
7樓2019-12-23 15:55:43
bridgeqbf
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 25.4
- 帖子: 27
- 在線: 6.5小時(shí)
- 蟲號: 724108
- 注冊: 2009-03-16
- 專業(yè): Chemistry
★ ★ ★
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
ghcacj(金幣+2):謝謝 2010-08-18 09:01:48
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
ghcacj(金幣+2):謝謝 2010-08-18 09:01:48
| I just read the function "is_hbond" in the code of gmx_hbond.c, it seems that hb is the common concept satisfying the distance and angle criteria, while #contact is the those contact which satisfy the distance criterion but not angle criterion. |
4樓2010-08-17 16:16:34
6樓2010-08-19 11:16:07
★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
|
本帖內(nèi)容被屏蔽 |
8樓2019-12-31 11:23:20
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 【求調(diào)劑】085601材料工程專碩 | 總分272 | +7 | 腳滑的守法公民 2026-03-27 | 7/350 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 化學(xué)工程085602 305分求調(diào)劑 +22 | RichLi_ 2026-03-25 | 22/1100 |
|
|
|
[考研] 277跪求調(diào)劑 +6 | 1915668 2026-03-27 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +4 | 青春裁為三截 2026-03-29 | 4/200 |
|
|
[考研] 071000生物學(xué)求調(diào)劑，初試成績343 +7 | 小小甜面團(tuán) 2026-03-25 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 壓國家一區(qū)線，求導(dǎo)師收留，有恩必謝！ +7 | 迷人的哈哈 2026-03-28 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 求化學(xué)調(diào)劑 +4 | wulanna 2026-03-28 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0703一志愿9，初試成績：338，四六級已過，有科研經(jīng)歷，求調(diào)劑！ +4 | Zuhui0306 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085602 307分 求調(diào)劑 +7 | 不知道叫什么！ 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 張芳銘-中國農(nóng)業(yè)大學(xué)-環(huán)境工程專碩-298 +4 | 手機(jī)用戶 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 070300化學(xué)求調(diào)劑 +4 | 起個(gè)名咋這么難 2026-03-27 | 4/200 |
|
|
|
[考研]
 一志愿 西北大學(xué) 總分282 英語一62 求調(diào)劑
+7
|
18419759900 2026-03-25 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 085601 材料工程 313分 求調(diào)劑 +5 | Ong3 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 351求調(diào)劑 +4 | 麥克阿磊 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 一志愿 本科 北科大 化學(xué) 343 +6 | 13831862839 2026-03-24 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 總分322求生物學(xué)/生化與分子/生物信息學(xué)相關(guān)調(diào)劑 +5 | 星沉uu 2026-03-26 | 6/300 |
|
|
|
[考研]
085602化學(xué)工程求調(diào)劑。
+4
|
平樂樂樂 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 26考研-291分-廈門大學(xué)（085601）-柔性電子學(xué)院材料工程專業(yè)求調(diào)劑 +3 | min3 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 考研一志愿蘇州大學(xué)初始315（英一）求調(diào)劑 +3 | sbdksD 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿重慶大學(xué)085700資源與環(huán)境，總分308求調(diào)劑 +7 | 墨墨漠 2026-03-23 | 8/400 |
|