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【原創(chuàng)】分子對接,同源模建,分子動力學(xué)軟件介紹帖
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">分子對接,同源模建,分子動力學(xué)軟件介紹帖 作為一個分子模擬領(lǐng)域的門外漢,主要應(yīng)用一些成型的軟件進行課題相關(guān)對象的模擬,在接觸分子模擬一年多的時間里,多多少少也接觸了一些分子對接,同源模建和分子動力學(xué)的軟件。在此想開一貼,介紹一下我用這些軟件的簡要介紹,自己的一些心得,也歡迎更多的蟲友能對這些方向的軟件進行介紹,補充,爭取做成一個系列。 初步列下我接觸過的軟件,以后將持續(xù)更新 同源模建: SWISS-MODEL MODELLER Geno3D phyre 分子對接: Autodock-5樓 MVD-7樓 iGEMDOCK-2樓 分子動力學(xué): DESMOND NAMD GROMACS 這些軟件都僅僅是接觸過的,談不上精通,因此能提供的只是個簡單的介紹,其中比較熟悉的,比如AD, iGEMDOCK,Modeller以及SWISS-MODEL可以詳細(xì)點介紹,其它的就僅當(dāng)拋磚引玉,希望能引起大家對這些軟件應(yīng)用的探討,共同進步。 [ Last edited by zh1987hs on 2010-9-18 at 00:07 ] |
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