 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1701 | 回復(fù): 3 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
vip_zzc銅蟲 (小有名氣)
|
[交流]
【討論】（急！�。┤绾斡肁MBER模擬RNA/DNA，關(guān)鍵是怎么處理輸入文件��！
|
||
|
本人在模擬核酸過程中遇到非常棘手的問題。 目前用的版本是 AMBER8，教程上說10（或者10）以前的版本會報錯，提示 有不能識別的原子。 Created a new atom named: H5'' within residue: .R Created a new atom named: H2' within residue: .R Created a new atom named: H2'' within residue: .R Added missing heavy atom: .R Added missing heavy atom: .R Created a new atom named: OP1 within residue: .R Created a new atom named: OP2 within residue: .R Created a new atom named: H5' within residue: .R Created a new atom named: H5'' within residue: .R Created a new atom named: H2' within residue: .R Created a new atom named: H2'' within residue: .R Added missing heavy atom: .R Added missing heavy atom: .R Created a new atom named: OP1 within residue: .R Created a new atom named: OP2 within residue: .R Created a new atom named: H5' within residue: .R Created a new atom named: H5'' within residue: .R Created a new atom named: H2' within residue: .R Created a new atom named: H2'' within residue: .R Added missing heavy atom: .R Added missing heavy atom: .R Created a new atom named: OP1 within residue: .R Created a new atom named: OP2 within residue: .R Created a new atom named: H5' within residue: .R Created a new atom named: H5'' within residue: .R Created a new atom named: H2' within residue: .R Created a new atom named: H2'' within residue: .R Created a new atom named: HO3' within residue: .R 但參看一些資料有人用AMBER6 都模擬出來了。。 AMBER是完全可以做出來的，關(guān)鍵是PDB輸入文件的該如何處理。。 現(xiàn)在很著急,摸索了好久一點進展都沒有.... 請教哪位有 用AMBER模擬過RNA/DNA的, 懇請能提供幫助,萬分感謝!!!!! QQ:350282689 E-mial:vip_zzc@emails.bjut.edu.cn |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
309求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
一志愿南航 335分 | 0856 | GPA 4.07 | 有科研經(jīng)歷
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
求化學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
085600，材料與化工321分求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
0703 化學(xué) 求調(diào)劑，一志愿山東大學(xué) 342 分
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿南開大學(xué)0710生物學(xué)359求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
085600，專業(yè)課化工原理，320分求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
材料與化工272求調(diào)劑
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
290求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- RNA樣品中的未除盡基因組DNA
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 有關(guān)提取全血DNA和RNA問題。
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 提RNA的時候怎么才能避免ＤＮＡ污染呢？
已經(jīng)有18人回復(fù)
- DNA/RNA抽提操作中用到的carrier RNA的分類、作用、原理？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 有人做過人工microRNA以使目標(biāo)基因沉默嗎？求助~~
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助/交流】異硫氰酸胍法提取植物RNA中DNA殘留問題~回帖就送幣�。�！
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 【求助/交流】怎么判斷提的DNA中有RNA 呢？
已經(jīng)有12人回復(fù)
夏天的魚
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 2475.1
- 散金: 39
- 紅花: 2
- 帖子: 269
- 在線: 106.2小時
- 蟲號: 960429
- 注冊: 2010-03-03
- 專業(yè): 化學(xué)計量學(xué)與化學(xué)信息學(xué)
4樓2010-10-10 15:33:42
ysh
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 4689.3
- 散金: 244
- 帖子: 986
- 在線: 102.2小時
- 蟲號: 564203
- 注冊: 2008-05-27
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
2樓2010-10-08 20:11:19
zhuhongaaa
金蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 396.9
- 紅花: 2
- 帖子: 607
- 在線: 23小時
- 蟲號: 748787
- 注冊: 2009-04-14
- 性別: GG
- 專業(yè): 高分子物理與高分子物理化
3樓2010-10-09 11:58:06
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 求調(diào)劑 +4 | QiMing7 2026-03-25 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 材料科學(xué)與工程求調(diào)劑 +6 | 深V宿舍吧 2026-03-29 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 318一志愿吉林大學(xué)生物與醫(yī)藥 求調(diào)劑 +4 | 篤行致遠. 2026-03-28 | 4/200 |
|
|
[考研] 295求調(diào)劑 +4 | wei-5 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 生物學(xué)學(xué)碩，一志愿湖南大學(xué)，初試成績338 +6 | YYYYYNNNNN 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 085701環(huán)境工程，267求調(diào)劑 +16 | minht 2026-03-26 | 16/800 |
|
|
|
[考研] 291求調(diào)劑 +15 | hhhhxn.. 2026-03-23 | 21/1050 |
|
|
|
[考研] 一志愿上海理工能源動力（085800）310分求調(diào)劑 +3 | zhangmingc 2026-03-27 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 308求調(diào)劑 +7 | 墨墨漠 2026-03-25 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 348求調(diào)劑 +4 | 小懶蟲不懶了 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | question挽風(fēng) 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 劉柯@ 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +4 | lim0922 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料調(diào)劑 +8 | 匹克i 2026-03-23 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 081200-11408-276學(xué)碩求調(diào)劑 +4 | 崔wj 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +6 | wfh030413@ 2026-03-23 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿河工大 081700 276求調(diào)劑 +4 | 地球繞著太陽轉(zhuǎn) 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 303求調(diào)劑 +6 | 藍山月 2026-03-25 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 080500求調(diào)劑 +3 | zzzzfan 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 284求調(diào)劑 +3 | yanzhixue111 2026-03-23 | 6/300 |
|