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thh2008銅蟲 (初入文壇)
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[交流]
【求助/交流】完整ORF判斷的軟件 已有7人參與
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| 請(qǐng)問一下大家，有沒有哪個(gè)網(wǎng)址或軟件可以判斷所克隆的ORF是否是完整的？謝謝！ |
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小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
scelab(金幣+5):熱心~~~ 2010-10-14 22:27:30
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scelab(金幣+5):熱心~~~ 2010-10-14 22:27:30
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這個(gè)圖的意思是： 在判定ORF時(shí)，因?yàn)樾蛄蟹较虻牟欢ㄐ�，所以程序�?huì)從正反兩端做查找。 根據(jù)密碼子的三聯(lián)體特性，所以查找時(shí)會(huì)移碼查找，以下面這段序列為例 aatttaaaaatttaattt正向有三個(gè)起始法：aat,att,ttt;反向也同樣有三種：ttt,tta,taa。 從你的這個(gè)結(jié)果來看，長度為1785的那個(gè)+3，在圖上是你的綠色條最長的那個(gè)是一 個(gè)完整的ORF，當(dāng)然剩下的綠條部分都是，但是這個(gè)最長，所以最有可能是你的目的 基因。 不知道我表述清楚了沒，  |
9樓2010-10-14 22:04:48
yixuanwin
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10樓2010-10-15 09:30:29
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