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[交流]
【求助/交流】熱不對(duì)稱PCR的問題,回帖就送金幣。《嘀x幫忙回答的,幫頂?shù)模。? 已有12人參與
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首先,熱不對(duì)稱PCR的好處是什么?它主要用來擴(kuò)已知序列的旁側(cè)基因,然后通過 一步步提高退火溫度,最后達(dá)到P出一條帶的目的。這樣理解對(duì)嗎? 其次,我現(xiàn)在做啟動(dòng)子的染色體步移,加了接頭后。試劑盒也是推薦用熱不對(duì)稱PCR。但這時(shí)我知道我的接頭序列,又知道我的已知序列,完全可以用普通PCR擴(kuò)嘛。這樣想對(duì)嗎? 還有,不太理解接頭引物AP和特異性引物GSP之間在片段長(zhǎng)度和退火上的差異。試劑盒上的:AP1:22個(gè)堿基 51度退火 AP2:19, 57度 。而建議我的GSP:25~28個(gè)堿基, 退火和GC和AP差不多。為什么堿基數(shù)差那么多? 最后,2步法PCR(94度,64度)和3步法(94,退火,72度)有什么區(qū)別?好處是? 大家一起來討論下這四個(gè)問題吧。《嘀x了~~~謝謝。。! 回帖就有金幣,每人可領(lǐng)5次。 |
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樓上的太不厚道了,我說一下我的想法,呵呵 第一,你所說的熱不對(duì)稱PCR實(shí)際上是TOUCHDOWN PCR的逆過程,這是在模板量較少或這是引物與模板親和力較弱時(shí)使用的,目的是前面低溫退火經(jīng)過低特異性的擴(kuò)增獲得大量的模板,在提高退火溫度,進(jìn)行特異性高的擴(kuò)增,或得目的產(chǎn)物。 第二,普通PCR由于沒有中間的基因特異性引物,這樣就導(dǎo)致上下游引物之間的距離很長(zhǎng),也就是PCR的產(chǎn)物片段太長(zhǎng),從而使PCR得保真度降低,效率降低。所以在普通PCR的上下游引物之間加上GSP縮短的產(chǎn)物長(zhǎng)度。 第三,解釋不清楚,可以查一下Tm值除了GC含量外,還有其他的影響因素沒。 第四,兩步法PCR節(jié)約了時(shí)間,同時(shí)提高了退火溫度,增加了特異性。 以上僅為個(gè)人己見,有不妥之處,望各為蟲友指正,見諒。謝謝! |
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