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kakaqa銅蟲(chóng) (初入文壇)
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【求助/交流】有關(guān)克隆方面的問(wèn)題 已有4人參與
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本人在做兩個(gè)基因的克隆,使用Takara的EXtaq擴(kuò)增出了DNA全長(zhǎng),分別為1800bp和3000bp左右,使用pMD18-T載體做T-A克隆。 1800bp左右的菌液PCR得到了和我目的條帶一致的條帶,送樣測(cè)序結(jié)果找不到引物,經(jīng)過(guò)BLAST比對(duì)后發(fā)現(xiàn)根本不是我要的目的條帶,很困惑,為什么測(cè)序的結(jié)果找不到引物呢,是不是因?yàn)闆](méi)連接上;蛘呤俏腋揪蜎](méi)擴(kuò)出目的條帶?可是測(cè)序結(jié)果總要找到引物啊。我的連接體系是1μl載體,4μlDNA, 5μl SoulutionⅠ,16℃連接了1天,按道理來(lái)說(shuō)1800bp左右的片段連接過(guò)夜就可以了,為什么1天了也連接不上啊。 另外想問(wèn)一下3000bp的片段takara的載體不是很好連啊,我都做了2次了,都是沒(méi)有結(jié)果,郁悶死了,哪位高手能提供點(diǎn)意見(jiàn)啊。 |
新蟲(chóng) (初入文壇)
金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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發(fā)表下看法: 1、不建議用EXtaq,這個(gè)酶擴(kuò)短點(diǎn)兒的片段還行,1000bp以上就會(huì)出現(xiàn)很多錯(cuò)配了,即使連上了也沒(méi)法用,找個(gè)pfu系列的高保真酶擴(kuò)吧,我用takara公司的primerstar酶擴(kuò)3000bp沒(méi)有錯(cuò)配或缺失,建議你用這個(gè) 2、1800bp連T載體效率已經(jīng)很低了,3000bp連的話(huà)基本靠運(yùn)氣,成功率極低,不過(guò)你可以不斷的試,直到連上為止。建議你分成2段來(lái)擴(kuò),分別連到T載體上,測(cè)序成功后再連到一起,這樣把握大些。 3、PCR時(shí)退火溫度高些較好,沒(méi)有非特異的雜帶,另外操作時(shí)盡量要嚴(yán)謹(jǐn),避免出現(xiàn)不明的現(xiàn)象。 |
金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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