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luokei銅蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助】大家好，vmd能看生物分子活性嗎
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大家好，用namd跑的MD，能用vmd看生物分子活性嗎？有沒有變性 如果想做這方面的分析，用哪款軟件的哪個(gè)版塊好(=@__@=)哪？ 謝謝 |
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britney137803
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7樓2010-11-09 09:53:38
xulinan
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2樓2010-11-05 12:57:45
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3樓2010-11-05 15:01:15
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★ ★ ★
luokei(金幣+4): 2010-11-05 21:07:50
zh1987hs(金幣+3):謝謝 2010-11-05 21:34:11
luokei(金幣+4): 2010-11-05 21:07:50
zh1987hs(金幣+3):謝謝 2010-11-05 21:34:11
| rmsd的大小不能單獨(dú)來說穩(wěn)定性的，比如你比較一個(gè)野生型和一個(gè)突變體，整體值大的肯定就沒小的穩(wěn)定。構(gòu)象穩(wěn)定指的是單個(gè)蛋白模擬過程的rmsd變化情況，整體變化越小，基本在一個(gè)水平線上說明穩(wěn)定了。蛋白的關(guān)鍵區(qū)很多時(shí)候就是活性點(diǎn)，比如酶的活性中心，大部分蛋白的疏水核心，這些都在蛋白質(zhì)功能中起重要作用。 |
4樓2010-11-05 18:57:07
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