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我是胖胖熊金蟲 (初入文壇)
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[交流]
【求助】gromacs
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| 大蝦們，各位做gromacs的時候，通常都加入什么力場呀?請各位指點迷津！謝謝先啦！ |
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我是胖胖熊(金幣+3):我的輔酶是NADPH，貌似用gmx4.5中的所有力場都不適用，找了幾篇文獻(xiàn)，好像都沒有描述，我再看看，謝謝啦！ 2010-11-07 20:49:07
ghcacj(金幣+3):謝謝 2010-11-08 12:52:43
我是胖胖熊(金幣+3):我的輔酶是NADPH，貌似用gmx4.5中的所有力場都不適用，找了幾篇文獻(xiàn)，好像都沒有描述，我再看看，謝謝啦！ 2010-11-07 20:49:07
ghcacj(金幣+3):謝謝 2010-11-08 12:52:43
| 力場的加入是和你的模擬目的相關(guān)的，不同的模擬對象適用不同的力場，比如生物體系，主要用的是AMBER,CHARMM,GROMOS(最新的GMX4.5加入了前兩種力場），其他體系的可以嘗試opls-aa等力場，結(jié)合你看的相關(guān)文獻(xiàn)上用了什么力場來參考比問其他人來的準(zhǔn)確~畢竟還是你最了解你的研究對象~ |
2樓2010-11-07 13:54:06
3樓2010-11-07 20:54:31
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