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永不后悔2838

鐵蟲(chóng) (小有名氣)

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[交流] 【求助/交流】請(qǐng)問(wèn)高手，怎么確定一個(gè)基因的5‘UTR和3'UTR，感謝啦！已有3人參與

各位高手，怎么確定一個(gè)基因的5’UTR和3'UTR，不勝感激！

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時(shí)間是賊，偷走一切……

1樓 2010-12-12 21:59:54

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Originally posted by chentg at 2010-12-12 23:03:12:
有預(yù)測(cè)它們的軟件，具體記不起來(lái)了，網(wǎng)上查查。
最笨的辦法是首先在基因組上用基因預(yù)測(cè)軟件預(yù)測(cè)出基因來(lái)，然后它們的前后即是。但要分析這些前后的序列要滿足相應(yīng)UTR的特點(diǎn)。特點(diǎn)文獻(xiàn)中有。

謝謝了，我現(xiàn)在有這個(gè)基因的外顯子序列，而且已經(jīng)在基因組上比對(duì)出來(lái)。想找下它的5'和3'側(cè)翼序列的SNP，但是不知道第一個(gè)外顯子前和最后一個(gè)外顯子后多少個(gè)堿基屬于側(cè)翼序列，頭疼啊~

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時(shí)間是賊，偷走一切……

4樓2010-12-13 10:01:17

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chentg

木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

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rainwander(金幣+2):鼓勵(lì)積極參與~~~ 2010-12-13 00:15:55

有預(yù)測(cè)它們的軟件，具體記不起來(lái)了，網(wǎng)上查查。
最笨的辦法是首先在基因組上用基因預(yù)測(cè)軟件預(yù)測(cè)出基因來(lái)，然后它們的前后即是。但要分析這些前后的序列要滿足相應(yīng)UTR的特點(diǎn)。特點(diǎn)文獻(xiàn)中有。

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我為人人，人人為我。

2樓2010-12-12 23:03:12

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dhd997(金幣+1):謝謝交流 2010-12-13 08:57:03

5‘UTR，轉(zhuǎn)錄但不翻譯的區(qū)域，所以你要知道轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)和翻譯起始密碼。有相關(guān)的預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的在線軟件，再用軟件預(yù)測(cè)閱讀框(ORF)來(lái)確定翻譯起始密碼，通常是ATG。

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3樓2010-12-13 01:02:38

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Originally posted by wxf8470 at 2010-12-13 01:02:38:
5‘UTR，轉(zhuǎn)錄但不翻譯的區(qū)域，所以你要知道轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)和翻譯起始密碼。有相關(guān)的預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的在線軟件，再用軟件預(yù)測(cè)閱讀框(ORF)來(lái)確定翻譯起始密碼，通常是ATG。

謝謝了，我先再找找，還不會(huì)再請(qǐng)教您~

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5樓2010-12-13 10:02:05

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