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[交流]
求助：根據(jù)已知配體如何設(shè)計小分子配體 已有3人參與
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本人正在做一個配體的類似物的設(shè)計與合成，已經(jīng)有報道蛋白質(zhì)和配體的三維結(jié)構(gòu)圖，我也已經(jīng)分析出兩者可能的作用位點。該蛋白的天然配體是一個三塘，合成比較困難，本人想根據(jù)天然配體與蛋白的結(jié)合位點和空間位置，設(shè)計配體的類似物，使其也能與蛋白結(jié)合，并且結(jié)構(gòu)相對簡單，最終想找到一個小分子化合物，能夠有利于合成。 在這種情況下，我想到的是用計算機輔助藥物設(shè)計的方法，但由于以前沒有接觸過類似的工作，不知道應(yīng)該用什么軟件來進行模擬？有沒有軟件能把我設(shè)計的化合物轉(zhuǎn)變成三維結(jié)構(gòu)，然后導(dǎo)入到PYMOL等軟件中，可以分析它可能與蛋白的結(jié)合情況？或者與天然配體進行結(jié)構(gòu)對照？ 或者有沒有其它更好的方法？請大家多多指點，謝謝！ [ Last edited by bolix on 2011-1-13 at 21:53 ] |
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