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[求助]
哪位大蝦有分析基因表達差異的軟件。
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| 各位大俠,我通過RT-PCR做的基因表達,然后跑的凝膠電泳,現在想求一個軟件能分析跑出來的條帶的表達差異,哪位大蝦知道啊?希望能不吝賜教啊,非常感謝啊 |
【分子生物】EPI帖 | 核酸生物學實驗經驗 | 蛋白質生物學實驗經驗 |
榮譽版主 (知名作家)
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你可以下載這個免費的 ImageJ: http://rsbweb.nih.gov/ij/download.html 在里面選擇與你的操作系統(tǒng)對應的軟件,一般是32位的Windows吧: http://rsbweb.nih.gov/ij/download/win32/ij144-jdk6-setup.exe![]() 1.下載安裝之后,打開軟件,點擊 File>Open,打開你要分析的圖片; 2.點擊工具欄最左邊的矩形工具(Rectangular),然后框出要分析的條帶; 按Ctrl+M(或者點擊菜單欄Analyze>Measure),打開測量的Results窗口,里面的Area,Mean,Min,Max依次是面積,灰度平均值,灰度最小值,灰度最大值。其中的Mean就是你需要的。 3.可以放大或縮小圖片:點擊工具欄的放大鏡圖標,鼠標左鍵點擊圖片放大,右擊縮小。 4.測完一個條帶,再框出另一條條帶,按Ctrl+M,又得到新的值。重復操作直到所有條帶都分析完。結果都顯示在Results窗口。 5.Results窗口的數據可以Clear,或者Copy出來,這些就不細說了吧! 說明:條帶越白,數值越大,純黑是0,純白是255,這個適用于DNA瓊脂糖凝膠電泳(黑色背景,白色條帶);如果是蛋白質的SDS-PAGE(背景是白色,條帶是黑色),這時只需要用255減去測得的Mean值就ok了。這個軟件是免費、開源的,有很多插件可以下載,功能很強大滴。有興趣多多研究吧。 http://rsbweb.nih.gov/ij/plugins/index.html [ Last edited by 西瓜 on 2011-4-21 at 21:30 ] |
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