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溪兒維婭銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
哪位大蝦有分析基因表達(dá)差異的軟件啊？
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| 各位大俠，我通過RT-PCR做的基因表達(dá)，然后跑的凝膠電泳，現(xiàn)在想求一個軟件能分析跑出來的條帶的表達(dá)差異，哪位大蝦知道��？希望能不吝賜教啊，非常感謝啊 |
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 【分子生物】EPI帖 | 核酸生物學(xué)實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn) | 蛋白質(zhì)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn) |
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溪兒維婭
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5樓2011-04-21 21:11:09
西瓜
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4樓2011-04-21 17:02:22
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【答案】應(yīng)助回帖
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dhd997(金幣+6, EPI+1): good 2011-04-21 21:44:51
dhd997(金幣+6, EPI+1): good 2011-04-21 21:44:51
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你可以下載這個免費(fèi)的 ImageJ： http://rsbweb.nih.gov/ij/download.html 在里面選擇與你的操作系統(tǒng)對應(yīng)的軟件，一般是32位的Windows吧：  http://rsbweb.nih.gov/ij/download/win32/ij144-jdk6-setup.exe1.下載安裝之后，打開軟件，點(diǎn)擊 File>Open，打開你要分析的圖片； 2.點(diǎn)擊工具欄最左邊的矩形工具（Rectangular），然后框出要分析的條帶； 按Ctrl+M（或者點(diǎn)擊菜單欄Analyze>Measure），打開測量的Results窗口，里面的Area，Mean，Min，Max依次是面積，灰度平均值，灰度最小值，灰度最大值。其中的Mean就是你需要的。 3.可以放大或縮小圖片：點(diǎn)擊工具欄的放大鏡圖標(biāo)，鼠標(biāo)左鍵點(diǎn)擊圖片放大，右擊縮小。 4.測完一個條帶，再框出另一條條帶，按Ctrl+M，又得到新的值。重復(fù)操作直到所有條帶都分析完。結(jié)果都顯示在Results窗口。 5.Results窗口的數(shù)據(jù)可以Clear，或者Copy出來，這些就不細(xì)說了吧！  說明：條帶越白，數(shù)值越大，純黑是0，純白是255，這個適用于DNA瓊脂糖凝膠電泳（黑色背景，白色條帶）；如果是蛋白質(zhì)的SDS-PAGE（背景是白色，條帶是黑色），這時(shí)只需要用255減去測得的Mean值就ok了。這個軟件是免費(fèi)、開源的，有很多插件可以下載，功能很強(qiáng)大滴。有興趣多多研究吧。 http://rsbweb.nih.gov/ij/plugins/index.html [ Last edited by 西瓜 on 2011-4-21 at 21:30 ] |
6樓2011-04-21 21:27:25
溪兒維婭
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7樓2011-04-21 22:29:59
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