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mmojf新蟲 (初入文壇)
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[求助]
關(guān)于RNA以及cDNA電泳問題,拜求各位大俠指點(diǎn)
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蝦米我實(shí)驗(yàn)的目的是先提取RNA,然后將其反轉(zhuǎn)錄成cDNA,以cDNA為模板,進(jìn)行 PCR以獲取目的片段。實(shí)驗(yàn)材料為細(xì)菌,提取RNA 后進(jìn)行紫外分光進(jìn)行檢測濃度, 濃度比較高,260與280的OD比值也符合實(shí)驗(yàn)要求。但是反轉(zhuǎn)錄后進(jìn)行PCR無條 帶,高手指點(diǎn)后對RNA進(jìn)行電泳,電泳無條帶,同時Marker有條帶,證明是可能是 RNA問題,個人總結(jié)認(rèn)為是RNA發(fā)生降解,但不知道其降解過程發(fā)生在電泳過程中 還是保存過程中,提RNA完全按照說明書進(jìn)行,而且不明白RNA濃度高但電泳無條 帶的原理,就是濃度與完整性的關(guān)系。另外,如果出現(xiàn)這樣的問題,應(yīng)該如何避 免,蝦米還應(yīng)該如何操作?另附RNA和cDNA電泳圖兩張,請大俠指教!我的全部身 家就兩個金幣了……全都給你了……雖然不多…… PS:問題基本如下 1 電泳無條帶原因 2 RNA濃度與其完整性關(guān)系 3 出現(xiàn)問題,如何解決 |
新蟲 (初入文壇)
木蟲 (正式寫手)
銀蟲 (正式寫手)
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我也深受這個問題困擾。后來我做了一系列降解實(shí)驗(yàn)(故意在一些環(huán)節(jié)出問題,看RNA提取情況)。 相信我,過程都是平行重復(fù)3次。有空我會把整個實(shí)驗(yàn)發(fā)出來。 這里直接說結(jié)果吧: 1.RNA幾乎不會在電泳過程中降解,無論是放了很久的膠,還是很久沒換水的電泳液。 2.OD比值只能大概參考。因?yàn)椋?60和280不知有RNA會吸收,還有很多其他物質(zhì)。最后這個比值可能是許多原因綜合的結(jié)果。 3.就是RNA部分降解也能反轉(zhuǎn),PCR驗(yàn)證基本也沒問題。 另外,你的圖沒發(fā)上。具體情況沒發(fā)分析。 總之我的建議: 1.RNA提取的要點(diǎn)是選對方法,什么組織用什么方法(網(wǎng)上一堆方法,也有很多kit賣)。方法對了肯定能提出來,最多操作不好有部分降解。 2.操作嘛盡量快。 3.反轉(zhuǎn)錄的管子干凈,很多降解發(fā)生在反轉(zhuǎn)錄過程。但我的實(shí)驗(yàn)從沒出現(xiàn)過。 4.所有實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。是否3次都提不出來?3次都反轉(zhuǎn)沒結(jié)果? 有重復(fù)性的失敗才有討論價值。 5.最后,RNA提取真的只是個非常小而簡單的實(shí)驗(yàn),試劑是最重要的,不是怕污染而是怕過期!我用自來水溶RNA一樣條帶完整 (我當(dāng)時也被雷到)。 |
新蟲 (初入文壇)
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